RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPYL6Q8N831 410 aa16.95■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF186Q9NXI6 227 aa16.95■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PI4KAP2A4QPH2 592 aa16.94■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRPA1O75762 1119 aa16.94■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FKBP1BP68106 108 aa16.94■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa16.94■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSRNP1Q96S65 589 aa16.94■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GREM2Q9H772 168 aa16.94■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC4A2P04920 1241 aa16.93■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTLL11Q8NHH1 800 aa16.93■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.93■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEXNQ0ZGT2 675 aa16.93■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STK31Q9BXU1 1019 aa16.93■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MINPP1Q9UNW1 487 aa16.93■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC34A2O95436 690 aa16.92■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCT4P50991 539 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEURL1BA8MQ27 555 aa16.91■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DACT2Q5SW24 774 aa16.91■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO3BQ8WXR4 1341 aa16.9■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.9■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MXD3Q9BW11 206 aa16.9■□□□□ 0.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STRIP1Q5VSL9 837 aa16.89■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOB2Q70IA6 237 aa16.89■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa16.89■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OGFOD1Q8N543 542 aa16.89■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXW7Q969H0 707 aa16.89■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COA1Q9GZY4 146 aa16.89■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H7C1W4 665 aa16.88■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNT10BO00744 389 aa16.88■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 G2E3Q7L622 706 aa16.88■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LEMD3Q9Y2U8 911 aa16.88■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC27Q2M243 656 aa16.87■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.87■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TXNRD3Q86VQ6 643 aa16.87■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLA2G12BQ9BX93 195 aa16.87■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2Q2LH0YL09 131 aa16.86■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGA6P23229 1130 aa16.86■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOX10P56693 466 aa16.86■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GUL6 1792 aa16.86■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.86■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SASH1O94885 1247 aa16.86■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLRK1P26718 216 aa16.86■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NF2P35240 595 aa16.86■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP14P50281 582 aa16.86■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCKRQ14397 625 aa16.86■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.86■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASP7P55210 303 aa16.85■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FLIIQ13045 1269 aa16.85■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WWC1Q8IX03 1113 aa16.85■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPHOSPH8Q99549 860 aa16.85■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNA1FO60840 1977 aa16.85■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTLL5Q6EMB2 1281 aa16.84■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYH16Q9H6N6 1097 aa16.84■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16.84■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL16Q14005 1332 aa16.84■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.29
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ECM29Q5VYK3 1845 aa16.83■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSF1RP07333 972 aa16.83■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC184Q52MB2 194 aa16.83■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA0825Q8IV33 1275 aa16.83■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAAF4Q8WXU2 420 aa16.83■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNJ4P48050 445 aa16.82■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTF2IP78347 998 aa16.82■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHRNDQ07001 517 aa16.82■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.82■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D8O95759 1140 aa16.81■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TM4SF4P48230 202 aa16.81■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARMC9Q7Z3E5 817 aa16.81■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINS1Q8NG48 757 aa16.81■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPS5Q9UPZ3 1129 aa16.81■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FANCIQ9NVI1 1328 aa16.81■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SREBF2Q12772 1141 aa16.8■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD209Q9NNX6 404 aa16.8■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRS2Q9Y4H2 1338 aa16.8■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa16.8■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKG1Q13976 671 aa16.8■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAMB1P07942 1786 aa16.79■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR25O00155 361 aa16.79■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSC5DA1L4H1 1573 aa16.78■□□□□ 0.28
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNAP23O00161 211 aa16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms