RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418244.5

FOXD3-AS1-201, FOXD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXD3-AS1, Length 941 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 COA1Q9GZY4 146 aa22.13■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.13■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GNAI3P08754 354 aa22.12■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KLRK1P26718 216 aa22.12■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KCNJ4P48050 445 aa22.12■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.12■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.1■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SNAP23O00161 211 aa22.1■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.1■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 UBE4AQ14139 1066 aa22.09■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LRRC24Q50LG9 513 aa22.09■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 USP17L3A6NCW0 530 aa22.08■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 USP17L4A6NCW7 530 aa22.08■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.08■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.08■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.08■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.08■■□□□ 1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FOXN1O15353 648 aa22.07■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PLIN1O60240 522 aa22.07■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MTX1Q13505 466 aa22.07■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MICALL2Q8IY33 904 aa22.07■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.07■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GMLQ99445 158 aa22.07■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FBXO3Q9UK99 471 aa22.07■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SHTN1A0MZ66 631 aa22.06■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 H7C1D1 291 aa22.06■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EYA2O00167 538 aa22.06■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.06■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CD209Q9NNX6 404 aa22.06■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.06■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PASKQ96RG2 1323 aa22.06■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RLBP1P12271 317 aa22.05■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 METTL24Q5JXM2 366 aa22.05■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DACT2Q5SW24 774 aa22.05■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.05■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PDE8BO95263 885 aa22.04■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GNAI2P04899 355 aa22.04■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IL1R1P14778 569 aa22.04■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.04■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.04■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 COPRSQ9NQ92 184 aa22.04■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.04■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.04■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CIAO1O76071 339 aa22.03■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.03■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CNTROBQ8N137 903 aa22.03■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 AIDAQ96BJ3 306 aa22.03■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CNTNAP1P78357 1384 aa22.02■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.01■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MS4A1P11836 297 aa22.01■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.01■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.01■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SRGAP3O43295 1099 aa22■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 USP17L8P0C7I0 530 aa22■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FGFR2P21802 821 aa22■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GTF2IP78347 998 aa22■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EGFRP00533 1210 aa21.99■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MMP14P50281 582 aa21.99■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MXD3Q9BW11 206 aa21.99■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SIL1Q9H173 461 aa21.99■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.99■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GYG1P46976 350 aa21.98■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 VEGFBP49765 207 aa21.98■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.98■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.98■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PANK1Q8TE04 598 aa21.98■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FBXW7Q969H0 707 aa21.98■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.97■■□□□ 1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SASH1O94885 1247 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms