RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ALS2Q96Q42 1657 aa6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MRC1P22897 1456 aa6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FSD2A1L4K1 749 aa6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 JUNDP17535 347 aa6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATF3P18847 181 aa6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SH3BP2P78314 561 aa6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRT76Q01546 638 aa6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 XP32Q5T750 250 aa6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLC4A10Q6U841 1118 aa6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LINS1Q8NG48 757 aa6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DCAF5Q96JK2 942 aa6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM94Q12767 1356 aa6.55□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TNS3Q68CZ2 1445 aa6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 F6X3S4 739 aa6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HIP1O00291 1037 aa6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TIMP2P16035 220 aa6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GUCA2AQ02747 115 aa6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C14orf37Q86TY3 774 aa6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GPATCH3Q96I76 525 aa6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ORAI2Q96SN7 254 aa6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LGR6Q9HBX8 967 aa6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SNRKQ9NRH2 765 aa6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ADCY9O60503 1353 aa6.54□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PI4KAP2A4QPH2 592 aa6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HOXA2O43364 376 aa6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHMLP26374 656 aa6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NNTQ13423 1086 aa6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CUL4AQ13619 759 aa6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF790Q6PG37 636 aa6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRAK2O60296 914 aa6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PPFIA3O75145 1194 aa6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PHKG2P15735 406 aa6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MRE11P49959 708 aa6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SCARF1Q14162 830 aa6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CNTROBQ8N137 903 aa6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RUFY2Q8WXA3 655 aa6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KCNB2Q92953 911 aa6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BCL11AQ9H165 835 aa6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PXDNQ92626 1479 aa6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RAD50Q92878 1312 aa6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GRM8O00222 908 aa6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SRGAP3O43295 1099 aa6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SURF6O75683 361 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HSPA4P34932 840 aa6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GJA5P36382 358 aa6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COL18A1P39060 1754 aa6.51□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SGSM2O43147 1006 aa6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ADH1CP00326 375 aa6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LINC01559Q495D7 138 aa6.5□□□□□ -1.37
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms