RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
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FAAP20-206ENST00000414253 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
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FAAP20-206ENST00000414253 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.84■■■□□ 2.21
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FAAP20-206ENST00000414253 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
FAAP20-206ENST00000414253 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.84■■■□□ 2.21
FAAP20-206ENST00000414253 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.84■■■□□ 2.21
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FAAP20-206ENST00000414253 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.83■■■□□ 2.21
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FAAP20-206ENST00000414253 NR1I2O75469 434 aa28.82■■■□□ 2.2
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FAAP20-206ENST00000414253 FBXO3Q9UK99 471 aa28.82■■■□□ 2.2
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FAAP20-206ENST00000414253 GTF3C6Q969F1 213 aa28.81■■■□□ 2.2
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FAAP20-206ENST00000414253 ZNF165P49910 485 aa28.8■■■□□ 2.2
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FAAP20-206ENST00000414253 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
FAAP20-206ENST00000414253 NEK1Q96PY6 1258 aa28.8■■■□□ 2.2
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FAAP20-206ENST00000414253 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
FAAP20-206ENST00000414253 RESTQ13127 1097 aa28.79■■■□□ 2.2
FAAP20-206ENST00000414253 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa28.79■■■□□ 2.2
FAAP20-206ENST00000414253 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
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FAAP20-206ENST00000414253 CAVIN2O95810 425 aa28.79■■■□□ 2.2
FAAP20-206ENST00000414253 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.2
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FAAP20-206ENST00000414253 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa28.78■■■□□ 2.2
FAAP20-206ENST00000414253 SYNE4Q8N205 404 aa28.78■■■□□ 2.2
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FAAP20-206ENST00000414253 GPTP24298 496 aa28.77■■■□□ 2.2
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FAAP20-206ENST00000414253 NLRP10Q86W26 655 aa28.77■■■□□ 2.2
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FAAP20-206ENST00000414253 CDHR2Q9BYE9 1310 aa28.77■■■□□ 2.2
FAAP20-206ENST00000414253 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
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FAAP20-206ENST00000414253 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28.76■■■□□ 2.19
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FAAP20-206ENST00000414253 CDC25BP30305 580 aa28.75■■■□□ 2.19
FAAP20-206ENST00000414253 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.75■■■□□ 2.19
FAAP20-206ENST00000414253 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
FAAP20-206ENST00000414253 ADORA1P30542 326 aa28.75■■■□□ 2.19
FAAP20-206ENST00000414253 SYCP1Q15431 976 aa28.75■■■□□ 2.19
FAAP20-206ENST00000414253 XAGE2Q96GT9 111 aa28.75■■■□□ 2.19
FAAP20-206ENST00000414253 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
FAAP20-206ENST00000414253 DSCC1Q9BVC3 393 aa28.75■■■□□ 2.19
FAAP20-206ENST00000414253 CLIP2Q9UDT6 1046 aa28.75■■■□□ 2.19
FAAP20-206ENST00000414253 CFAP45Q9UL16 551 aa28.75■■■□□ 2.19
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