RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413522.1

SNORD56-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

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Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56-201ENST00000413522 HHIPQ96QV1 700 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD56-201ENST00000413522 SETDB2Q96T68 719 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD56-201ENST00000413522 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SNORD56-201ENST00000413522 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD56-201ENST00000413522 LACRTQ9GZZ8 138 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD56-201ENST00000413522 EHD4Q9H223 541 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD56-201ENST00000413522 PRDM6Q9NQX0 595 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD56-201ENST00000413522 STK17AQ9UEE5 414 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD56-201ENST00000413522 MKL2Q9ULH7 1088 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD56-201ENST00000413522 TRIM33Q9UPN9 1127 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD56-201ENST00000413522 FAM177BA6PVY3 158 aa4.78□□□□□ -1.64
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SNORD56-201ENST00000413522 IL22RA1Q8N6P7 574 aa4.78□□□□□ -1.64
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SNORD56-201ENST00000413522 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 GRIK5Q16478 980 aa4.77□□□□□ -1.65
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SNORD56-201ENST00000413522 PI16Q6UXB8 463 aa4.77□□□□□ -1.65
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SNORD56-201ENST00000413522 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.77□□□□□ -1.65
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SNORD56-201ENST00000413522 PLVAPQ9BX97 442 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 BCL2L13Q9BXK5 485 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 LIN7BQ9HAP6 207 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 PPP4R2Q9NY27 417 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 SPDYE3A6NKU9 549 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 METTL12A8MUP2 240 aa4.76□□□□□ -1.65
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SNORD56-201ENST00000413522 CDC27P30260 824 aa4.76□□□□□ -1.65
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SNORD56-201ENST00000413522 GRM2Q14416 872 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 FBXO33Q7Z6M2 555 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 CCNJLQ8IV13 435 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 TRIM11Q96F44 468 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 SUV39H2Q9H5I1 410 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 TRAK1Q9UPV9 953 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 SPG7Q9UQ90 795 aa4.76□□□□□ -1.65
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SNORD56-201ENST00000413522 BSNDQ8WZ55 320 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 TCF12Q99081 682 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 BCO2Q9BYV7 579 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 ADAM19Q9H013 955 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 MUC3BQ9H195 1237 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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SNORD56-201ENST00000413522 A0A1W2PPZ6 126 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 LINC01387J3KSC0 135 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 EPHA1P21709 976 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 GNA15P30679 374 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 GRIA4P48058 902 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 FCGRTP55899 365 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 RAC1P63000 192 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 SPRED3Q2MJR0 410 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 PRRT3Q5FWE3 981 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 FAM117BQ6P1L5 589 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 TXNDC11Q6PKC3 985 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 FRMD6Q96NE9 622 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 RNF19AQ9NV58 838 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 PARP2Q9UGN5 583 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 A0A0A0MRY4 1105 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 FAM229AH3BQW9 127 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 GIPC1O14908 333 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 PSMD2Q13200 908 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 RGS22Q8NE09 1264 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 GLIS3Q8NEA6 775 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 FAM161BQ96MY7 647 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 OSBPL7Q9BZF2 842 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 SOX13Q9UN79 622 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD56-201ENST00000413522 AKAP2Q9Y2D5 859 aa4.73□□□□□ -1.65
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