RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 PSAPP07602 524 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 LIG3P49916 1009 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 LMNB2Q03252 620 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 TNP2Q05952 138 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 CEP120Q8N960 986 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 OSMRQ99650 979 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLAURQ03405 335 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 PNMA5Q96PV4 448 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 F6X3S4 739 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 KLF4O43474 513 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 FBXO24O75426 580 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 PF4P02776 101 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 THBS1P07996 1170 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 ETFBP38117 255 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 MMRN1Q13201 1228 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 MAP3K11Q16584 847 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 MARK1Q9P0L2 795 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-272P-201ENST00000411028 NFKBIEO00221 500 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 CELA3AP09093 270 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 BMP1P13497 986 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 NFKB1P19838 968 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 HSD3B2P26439 372 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 GRIA4P48058 902 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 NRLP54845 237 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPEM2Q0P670 501 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 RAB33AQ14088 237 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 NXPE3Q969Y0 559 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZFP42Q96MM3 310 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 STRN4Q9NRL3 753 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A096LPE4 126 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A1W2PPZ6 126 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 H7C1W4 665 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 ENC1O14682 589 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACPPP15309 386 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 TCEAL1Q15170 157 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 NKD1Q969G9 470 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPACA7Q96KW9 195 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 UBP1Q9NZI7 540 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLSTN1O94985 981 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 APOBRQ0VD83 1088 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 GRIN2CQ14957 1233 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 LRRC3Q9BY71 257 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF576Q9H609 170 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM187AA6NFU0 413 aa6.36□□□□□ -1.39
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