RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 GYG1P46976 350 aa28.36■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 KCNJ4P48050 445 aa28.36■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 TXNRD3Q86VQ6 643 aa28.36■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 SNRKQ9NRH2 765 aa28.36■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 DPEP1P16444 411 aa28.35■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 ARAP2Q8WZ64 1704 aa28.34■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 CDC45O75419 566 aa28.34■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 MCAMP43121 646 aa28.34■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 TMC4Q7Z404 712 aa28.34■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 IRS2Q9Y4H2 1338 aa28.34■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 CNTROBQ8N137 903 aa28.33■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 SLX4Q8IY92 1834 aa28.33■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 POLLQ9UGP5 575 aa28.33■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 LEMD3Q9Y2U8 911 aa28.33■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 CNKSR1Q969H4 720 aa28.32■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.32■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.32■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.32■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 LRRC37AA6NMS7 1700 aa28.31■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 CACNA1SQ13698 1873 aa28.31■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 EVI5LQ96CN4 794 aa28.31■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 GOLIM4O00461 696 aa28.31■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 UFL1O94874 794 aa28.31■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.31■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 ZAP70P43403 619 aa28.3■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.3■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 CHMLP26374 656 aa28.3■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 RASGRF1Q13972 1273 aa28.3■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 FBXO33Q7Z6M2 555 aa28.3■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 PAG1Q9NWQ8 432 aa28.3■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 GGA1Q9UJY5 639 aa28.3■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 KLHL34Q8N239 644 aa28.29■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 HMG20BQ9P0W2 317 aa28.29■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.28■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 AKAP11Q9UKA4 1901 aa28.28■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 CHGBP05060 677 aa28.28■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa28.28■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 ATP2B4P23634 1241 aa28.28■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 TGFB2P61812 414 aa28.28■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.28■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 LTBP1Q14766 1721 aa28.27■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 TTLL6Q8N841 843 aa28.27■■■□□ 2.12
CNN3-202ENST00000394202 MPNDQ8N594 471 aa28.26■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 SPON1Q9HCB6 807 aa28.26■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa28.26■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 C6orf229H3BNL8 230 aa28.26■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 VPS37DQ86XT2 251 aa28.26■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 SPATA5Q8NB90 893 aa28.26■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 FSD1Q9BTV5 496 aa28.26■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 IL25Q9H293 177 aa28.26■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 DLEC1Q9Y238 1755 aa28.25■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.25■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 AK9Q5TCS8 1911 aa28.25■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 C21orf2O43822 256 aa28.24■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.24■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.24■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 SLFNL1Q499Z3 407 aa28.23■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 PIM2Q9P1W9 311 aa28.21■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 CASC1Q6TDU7 716 aa28.2■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 SNED1Q8TER0 1413 aa28.2■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 FAM227BQ96M60 508 aa28.2■■■□□ 2.11
CNN3-202ENST00000394202 RIMBP2O15034 1052 aa28.2■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.2■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa28.2■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 UTRNP46939 3433 aa28.19■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa28.19■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 MED23Q9ULK4 1368 aa28.18■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 JAG2Q9Y219 1238 aa28.18■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 ZNF804AQ7Z570 1209 aa28.17■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 A0A0D9SFI3 127 aa28.17■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 CD209Q9NNX6 404 aa28.16■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 DENND2AQ9ULE3 1009 aa28.16■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 WASHC4Q2M389 1173 aa28.15■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
CNN3-202ENST00000394202 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms