RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380956.8

IRF4-201, Transcript of interferon regulatory factor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF4, Length 5,331 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4-201ENST00000380956 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 IGSF22Q8N9C0 903 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 PARD6BQ9BYG5 372 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 KANK3Q6NY19 840 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 CCDC170Q8IYT3 715 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 PIK3R5Q8WYR1 880 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 STK38LQ9Y2H1 464 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 CLTAP09496 248 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 GBP1P32455 592 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 IL16Q14005 1332 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 NR1I2O75469 434 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 CNGA4Q8IV77 575 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 TAOK3Q9H2K8 898 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 HMG20BQ9P0W2 317 aa16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 PDE6BP35913 854 aa16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 ANKRD7Q92527 254 aa16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 CABP1Q9NZU7 370 aa16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 PTPRCP08575 1304 aa16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 IFT88Q13099 833 aa16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 CEP85Q6P2H3 762 aa16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 RUFY3Q7L099 469 aa16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 ADKP55263 362 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 MAP3K9P80192 1104 aa16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 A0A1W2PRG0 241 aa16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 PPFIA4O75335 1185 aa16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 C8orf74Q6P047 294 aa16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 CEP128Q6ZU80 1094 aa16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 TRIM47Q96LD4 638 aa16.48■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 PTPRKQ15262 1439 aa16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 AMOTL1Q8IY63 956 aa16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 STIM2Q9P246 746 aa16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 DBN1Q16643 649 aa16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 RHPN1Q8TCX5 695 aa16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 ZMYM3Q14202 1370 aa16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 HINFPQ9BQA5 517 aa16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.47■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 EID1Q9Y6B2 187 aa16.46■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 UBXN1Q04323 297 aa16.46■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 IQCA1Q86XH1 822 aa16.46■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 CCDC42Q96M95 316 aa16.46■□□□□ 0.23
IRF4-201ENST00000380956 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 SETDB1Q15047 1291 aa16.46■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 KIAA0753Q2KHM9 967 aa16.46■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 TRIM7Q9C029 511 aa16.46■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 FAM83GA6ND36 823 aa16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 GUCY2CP25092 1073 aa16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 SNX14Q9Y5W7 946 aa16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 ATAD2Q6PL18 1390 aa16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 SPAG1Q07617 926 aa16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 SLFNL1Q499Z3 407 aa16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 KCNK9Q9NPC2 374 aa16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 ARID5BQ14865 1188 aa16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 CREB3L3Q68CJ9 461 aa16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 GBP5Q96PP8 586 aa16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 LRRD1A4D1F6 860 aa16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 HAND2P61296 217 aa16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 DIXDC1Q155Q3 683 aa16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 VPS36Q86VN1 386 aa16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 PFDN1O60925 122 aa16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 VPS37DQ86XT2 251 aa16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 PSMB7Q99436 277 aa16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 PTPDC1A2A3K4 754 aa16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 ST5P78524 1137 aa16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 SATB1Q01826 763 aa16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 NUTM2GQ5VZR2 741 aa16.44■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 GOLGA8AA7E2F4 631 aa16.43■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 KCTD16Q68DU8 428 aa16.43■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 STMN2Q93045 179 aa16.43■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 YY1AP1Q9H869 796 aa16.43■□□□□ 0.22
IRF4-201ENST00000380956 CCDC151A5D8V7 595 aa16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms