RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa29■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 AACSQ86V21 672 aa28.99■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 ADORA1P30542 326 aa28.98■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.98■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 LNPKQ9C0E8 428 aa28.98■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 SLC5A1P13866 664 aa28.98■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 GPR162Q16538 588 aa28.98■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.98■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 SBF1O95248 1867 aa28.97■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.97■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 MED23Q9ULK4 1368 aa28.96■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 RASSF7Q02833 373 aa28.96■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa28.96■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 XAGE2Q96GT9 111 aa28.96■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 DBNDD2Q9BQY9 259 aa28.96■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.95■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.95■■■□□ 2.23
PDSS1-201ENST00000376215 WASHC4Q2M389 1173 aa28.94■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 RIMBP2O15034 1052 aa28.94■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 GYG1P46976 350 aa28.94■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 PRELPP51888 382 aa28.94■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 COL4A5P29400 1685 aa28.94■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 EYA3Q99504 573 aa28.93■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 CHD4Q14839 1912 aa28.93■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 AOC3Q16853 763 aa28.92■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 BCAMP50895 628 aa28.91■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.91■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.91■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 PDE4AP27815 886 aa28.91■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 FBXO33Q7Z6M2 555 aa28.91■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 SKAP1Q86WV1 359 aa28.91■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.9■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 PPIP5K2O43314 1243 aa28.9■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 PHKA1P46020 1223 aa28.89■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC102BQ68D86 513 aa28.89■■■□□ 2.22
PDSS1-201ENST00000376215 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.88■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 VPS33BQ9H267 617 aa28.88■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 GRIN3BO60391 1043 aa28.87■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
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PDSS1-201ENST00000376215 GORABQ5T7V8 394 aa28.87■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 AKAP11Q9UKA4 1901 aa28.87■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 SCN9AQ15858 1988 aa28.87■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF804AQ7Z570 1209 aa28.87■■■□□ 2.21
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PDSS1-201ENST00000376215 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.86■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 DBNDD1Q9H9R9 158 aa28.86■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 MX1P20591 662 aa28.85■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 VPS37DQ86XT2 251 aa28.85■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 CD209Q9NNX6 404 aa28.85■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.84■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 COA1Q9GZY4 146 aa28.84■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 CCDC158Q5M9N0 1113 aa28.83■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 ECE2O60344 883 aa28.83■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 IL1R1P14778 569 aa28.83■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 LMNB1P20700 586 aa28.83■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 ECHDC1Q9NTX5 307 aa28.83■■■□□ 2.21
PDSS1-201ENST00000376215 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 PSME4Q14997 1843 aa28.82■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 PDE1AP54750 535 aa28.82■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 SCARF1Q14162 830 aa28.82■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 TTC39AQ5SRH9 613 aa28.82■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 STAP2Q9UGK3 403 aa28.82■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.81■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 YDJCA8MPS7 323 aa28.8■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 RASGRF1Q13972 1273 aa28.8■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 TTC41PQ6P2S7 1318 aa28.8■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 G3V3G9 751 aa28.8■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 MCAMP43121 646 aa28.8■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.8■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 PI4K2BQ8TCG2 481 aa28.8■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 KCNQ5Q9NR82 932 aa28.8■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa28.79■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 ATP5JP18859 108 aa28.79■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 PI16Q6UXB8 463 aa28.79■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 PODNQ7Z5L7 613 aa28.79■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 NIM1KQ8IY84 436 aa28.79■■■□□ 2.2
PDSS1-201ENST00000376215 GPATCH3Q96I76 525 aa28.79■■■□□ 2.2
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