RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 SNX14Q9Y5W7 946 aa18.51■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 ARAP2Q8WZ64 1704 aa18.51■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa18.5■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa18.5■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 MAP4K1Q92918 833 aa18.5■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.5■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 MED23Q9ULK4 1368 aa18.5■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 NECTIN1Q15223 517 aa18.5■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 GYG1P46976 350 aa18.49■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 NEK4P51957 841 aa18.49■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 ANAPC15P60006 121 aa18.49■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 ST5P78524 1137 aa18.49■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa18.49■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 MSL1Q68DK7 614 aa18.49■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa18.48■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 RFX7Q2KHR2 1363 aa18.48■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 M0R2C6 588 aa18.48■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 RASGRF1Q13972 1273 aa18.48■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 UBE4AQ14139 1066 aa18.48■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 NLGN1Q8N2Q7 840 aa18.48■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA5Q8NB90 893 aa18.48■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 OSBP2Q969R2 916 aa18.48■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 HELLSQ9NRZ9 838 aa18.48■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 MYH7P12883 1935 aa18.47■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 KLRK1P26718 216 aa18.47■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 GRAPQ13588 217 aa18.47■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 DEFB132Q7Z7B7 95 aa18.47■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 IL17RAQ96F46 866 aa18.47■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.47■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 KCNJ4P48050 445 aa18.46■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 VPS53Q5VIR6 699 aa18.46■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 CREB3L3Q68CJ9 461 aa18.46■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.46■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 TAF6LQ9Y6J9 622 aa18.46■□□□□ 0.55
CASQ1-201ENST00000368078 CPA1P15085 419 aa18.46■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 SLC15A2Q16348 729 aa18.46■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 ADCK5Q3MIX3 580 aa18.46■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 SLC27A2O14975 620 aa18.45■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 WASHC4Q2M389 1173 aa18.45■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 CRY2Q49AN0 593 aa18.45■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 KCNB2Q92953 911 aa18.45■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 MAST3O60307 1309 aa18.45■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa18.44■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 ST18O60284 1047 aa18.44■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 IDH1O75874 414 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 MMP10P09238 476 aa18.44■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 WWC3Q9ULE0 1092 aa18.44■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa18.43■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 TXNRD3Q86VQ6 643 aa18.43■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD2Q9GZV1 360 aa18.43■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa18.43■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 TICAM2Q86XR7 235 aa18.43■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa18.42■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF804BA4D1E1 1349 aa18.42■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 A0A0G2JLW4 131 aa18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 ADD2P35612 726 aa18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 FBXO33Q7Z6M2 555 aa18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 PARP3Q9Y6F1 533 aa18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 CASTP20810 708 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 CAVIN4Q5BKX8 364 aa18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 VPS37DQ86XT2 251 aa18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 STK32BQ9NY57 414 aa18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF532Q9HCE3 1301 aa18.41■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 PDE6AP16499 860 aa18.4■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 GPSM2P81274 684 aa18.4■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 APPBP2Q92624 585 aa18.4■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa18.39■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 BRIP1Q9BX63 1249 aa18.39■□□□□ 0.54
CASQ1-201ENST00000368078 NRXN2Q9P2S2 1712 aa18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms