RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 UBN2Q6ZU65 1347 aa8.62□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 CCDC27Q2M243 656 aa8.62□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.62□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 CCDC91Q7Z6B0 441 aa8.62□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 JRKLQ9Y4A0 524 aa8.62□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 CD2APQ9Y5K6 639 aa8.62□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 LRRC37AA6NMS7 1700 aa8.62□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 COL4A1P02462 1669 aa8.62□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.62□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa8.62□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 GYS2P54840 703 aa8.61□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.61□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 SLX4Q8IY92 1834 aa8.61□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.61□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 CYP2C19P33261 490 aa8.61□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 PRELPP51888 382 aa8.61□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 RINLQ6ZS11 566 aa8.61□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 ABCC12Q96J65 1359 aa8.61□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 RASSF7Q02833 373 aa8.61□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.61□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.61□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.61□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 CTIFO43310 598 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 ATP2B1P20020 1258 aa8.6□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 TRDNQ13061 729 aa8.6□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 COPS6Q7L5N1 327 aa8.6□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 FAM212AQ96EL1 285 aa8.6□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.6□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 REC8O95072 547 aa8.6□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 MUM1L1Q5H9M0 696 aa8.6□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.6□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 KRT222Q8N1A0 295 aa8.6□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 DRC1Q96MC2 740 aa8.6□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.59□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 SETDB2Q96T68 719 aa8.59□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.59□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 NPHP1O15259 732 aa8.59□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 LIG1P18858 919 aa8.59□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 ERFEQ4G0M1 354 aa8.59□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 SUSD4Q5VX71 490 aa8.59□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.59□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8.59□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 SBF1O95248 1867 aa8.59□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 CTAGE5O15320 804 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 MAP9Q49MG5 647 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 MYO1CO00159 1063 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 COQ9O75208 318 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 PPP2R5AQ15172 486 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 G2E3Q7L622 706 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 CNBD1Q8NA66 436 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 DEF6Q9H4E7 631 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 BCAR3O75815 825 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 SYCP1Q15431 976 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 RPAINQ86UA6 219 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.58□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 A0A087WZG4 1122 aa8.57□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 GOLGA2Q08379 1002 aa8.57□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.57□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 ZNF446Q9NWS9 450 aa8.57□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.57□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.57□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 C21orf2O43822 256 aa8.57□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 ZNF445P59923 1031 aa8.57□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.57□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.57□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 IFT57Q9NWB7 429 aa8.57□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 TGFB2P61812 414 aa8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 KIF6Q6ZMV9 814 aa8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 KIF18AQ8NI77 898 aa8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 GBP4Q96PP9 640 aa8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 A0A1B0GUL7 405 aa8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 H0YHG0 523 aa8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 INHBEP58166 350 aa8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 PIM2Q9P1W9 311 aa8.56□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 TRIM66O15016 1216 aa8.55□□□□□ -1.04
CCR6-202ENST00000349984 SETDB1Q15047 1291 aa8.55□□□□□ -1.04
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