RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336070.11

FRMD1-202, Transcript of FERM domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene FRMD1, Length 1,600 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD1-202ENST00000336070 SNAP23O00161 211 aa22.21■■□□□ 1.15
FRMD1-202ENST00000336070 GGA1Q9UJY5 639 aa22.21■■□□□ 1.15
FRMD1-202ENST00000336070 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.21■■□□□ 1.15
FRMD1-202ENST00000336070 CHRNA5P30532 468 aa22.2■■□□□ 1.15
FRMD1-202ENST00000336070 PHKA1P46020 1223 aa22.2■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 GPSM2P81274 684 aa22.2■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.2■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.2■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 TAF1P21675 1872 aa22.2■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 SEMA3EO15041 775 aa22.19■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 BCAMP50895 628 aa22.19■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 VPS37DQ86XT2 251 aa22.19■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 TTLL6Q8N841 843 aa22.19■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 CHMLP26374 656 aa22.18■■□□□ 1.14
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FRMD1-202ENST00000336070 PTGER2P43116 358 aa22.18■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 MPNDQ8N594 471 aa22.18■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.18■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 SPON1Q9HCB6 807 aa22.18■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.18■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 MCAMP43121 646 aa22.17■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 KCNA3P22001 575 aa22.17■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.17■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.17■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.17■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.16■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 UFL1O94874 794 aa22.16■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 DPEP1P16444 411 aa22.16■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 GYG1P46976 350 aa22.16■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 SPATA5Q8NB90 893 aa22.16■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 FSD1Q9BTV5 496 aa22.16■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.16■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 SPEF2Q9C093 1822 aa22.16■■□□□ 1.14
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FRMD1-202ENST00000336070 GOLIM4O00461 696 aa22.15■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 SCARF1Q14162 830 aa22.15■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.15■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.15■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 PIM2Q9P1W9 311 aa22.15■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 A0A0G2JLW4 131 aa22.14■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 IGSF3O75054 1194 aa22.14■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 ZAP70P43403 619 aa22.14■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.14■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.14■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 POLLQ9UGP5 575 aa22.14■■□□□ 1.14
FRMD1-202ENST00000336070 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.14■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 C6orf229H3BNL8 230 aa22.13■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 RASGRF1Q13972 1273 aa22.13■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 SOGA3Q5TF21 947 aa22.13■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 MED23Q9ULK4 1368 aa22.13■■□□□ 1.13
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FRMD1-202ENST00000336070 REC8O95072 547 aa22.13■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.13■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 EYA3Q99504 573 aa22.13■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.12■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 SEC24BO95487 1268 aa22.12■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.12■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.12■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 SNRKQ9NRH2 765 aa22.12■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.12■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.11■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.11■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.11■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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FRMD1-202ENST00000336070 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.1■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 RAD50Q92878 1312 aa22.1■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 A0A1B0GUL6 1792 aa22.1■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 SGSM2O43147 1006 aa22.09■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 IL1R1P14778 569 aa22.09■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 WASHC4Q2M389 1173 aa22.09■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 CCDC93Q567U6 631 aa22.09■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 PI16Q6UXB8 463 aa22.09■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 COA1Q9GZY4 146 aa22.09■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 CD209Q9NNX6 404 aa22.09■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 MAP3K12Q12852 859 aa22.08■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
FRMD1-202ENST00000336070 VPS33BQ9H267 617 aa22.08■■□□□ 1.13
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