RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 H7C1W4 665 aa32.03■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 CCT4P50991 539 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 FANCIQ9NVI1 1328 aa32.02■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 GCKRQ14397 625 aa32.02■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC102AQ96A19 550 aa32.02■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 GMLQ99445 158 aa32.02■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 AKAP11Q9UKA4 1901 aa32.01■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC85CA6NKD9 419 aa32.01■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 MYH16Q9H6N6 1097 aa32.01■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 ITGA6P23229 1130 aa31.99■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM161AQ3B820 660 aa31.99■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 DNAAF4Q8WXU2 420 aa31.99■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 MPHOSPH8Q99549 860 aa31.98■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 MXD3Q9BW11 206 aa31.98■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 PLA2G12BQ9BX93 195 aa31.97■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 LEMD3Q9Y2U8 911 aa31.97■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 ANP32CO43423 234 aa31.96■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 COA1Q9GZY4 146 aa31.96■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa31.96■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa31.96■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC10A3P09131 477 aa31.95■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 DACT2Q5SW24 774 aa31.95■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 TXNRD3Q86VQ6 643 aa31.95■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 OGFOD1Q8N543 542 aa31.95■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 LINS1Q8NG48 757 aa31.95■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 MCOLN1Q9GZU1 580 aa31.95■■■□□ 2.71
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF804BA4D1E1 1349 aa31.95■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 CASP7P55210 303 aa31.94■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 ANKRD2Q9GZV1 360 aa31.94■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 VAMP4O75379 141 aa31.93■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 KCNJ4P48050 445 aa31.93■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 DGKZQ13574 1117 aa31.93■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 NBPF9Q3BBW0 867 aa31.93■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 STRIP1Q5VSL9 837 aa31.93■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 MYO3BQ8WXR4 1341 aa31.93■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 KLRK1P26718 216 aa31.92■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 WDR63Q8IWG1 891 aa31.92■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 CSF1RP07333 972 aa31.91■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa31.9■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 TRPA1O75762 1119 aa31.9■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 FKBP1BP68106 108 aa31.9■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa31.9■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 SAGE1Q9NXZ1 904 aa31.9■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 CHMP3Q9Y3E7 222 aa31.9■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 CHRNDQ07001 517 aa31.89■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 TTLL5Q6EMB2 1281 aa31.89■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 RASAL3Q86YV0 1011 aa31.89■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 RNF186Q9NXI6 227 aa31.89■■■□□ 2.7
PPP4R4-202ENST00000328839 A0A1B0GUL6 1792 aa31.89■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 F6X3S4 739 aa31.88■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 MOB2Q70IA6 237 aa31.88■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 WNT10BO00744 389 aa31.87■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 SASH1O94885 1247 aa31.87■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 KIAA0825Q8IV33 1275 aa31.87■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 CSRNP1Q96S65 589 aa31.87■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 GTF2IP78347 998 aa31.86■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 HDAC9Q9UKV0 1011 aa31.85■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 UBE2Q2LH0YL09 131 aa31.84■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 NF2P35240 595 aa31.84■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 TAF5LO75529 589 aa31.83■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
PPP4R4-202ENST00000328839 SNAP23O00161 211 aa31.82■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 FOXO4P98177 505 aa31.82■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 BEND3Q5T5X7 828 aa31.82■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 CD209Q9NNX6 404 aa31.82■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 MMP14P50281 582 aa31.81■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM9BQ8IZU0 186 aa31.81■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 TAF7LQ5H9L4 462 aa31.79■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 LMBR1LQ6UX01 489 aa31.79■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 ECM29Q5VYK3 1845 aa31.77■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 PRKG1Q13976 671 aa31.77■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC57Q2TAC2 916 aa31.77■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF804AQ7Z570 1209 aa31.77■■■□□ 2.68
PPP4R4-202ENST00000328839 GRM8O00222 908 aa31.76■■■□□ 2.67
PPP4R4-202ENST00000328839 PLIN1O60240 522 aa31.76■■■□□ 2.67
PPP4R4-202ENST00000328839 EPHA10Q5JZY3 1008 aa31.76■■■□□ 2.67
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC4A10Q6U841 1118 aa31.76■■■□□ 2.67
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
PPP4R4-202ENST00000328839 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
PPP4R4-202ENST00000328839 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
PPP4R4-202ENST00000328839 DLGAP5Q15398 846 aa31.75■■■□□ 2.67
PPP4R4-202ENST00000328839 IRS2Q9Y4H2 1338 aa31.75■■■□□ 2.67
PPP4R4-202ENST00000328839 F8W031 263 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
PPP4R4-202ENST00000328839 RGS19P49795 217 aa31.74■■■□□ 2.67
PPP4R4-202ENST00000328839 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa31.74■■■□□ 2.67
PPP4R4-202ENST00000328839 ARMC9Q7Z3E5 817 aa31.74■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms