RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 TAF1LQ8IZX4 1826 aa13.51□□□□□ -0.25
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PGA3-201ENST00000325558 FBXL16Q8N461 479 aa13.51□□□□□ -0.25
PGA3-201ENST00000325558 FBXO41Q8TF61 875 aa13.51□□□□□ -0.25
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PGA3-201ENST00000325558 NEK1Q96PY6 1258 aa13.51□□□□□ -0.25
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PGA3-201ENST00000325558 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
PGA3-201ENST00000325558 FAM177BA6PVY3 158 aa13.43□□□□□ -0.26
PGA3-201ENST00000325558 GPAA1O43292 621 aa13.43□□□□□ -0.26
PGA3-201ENST00000325558 PDE6AP16499 860 aa13.43□□□□□ -0.26
PGA3-201ENST00000325558 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
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PGA3-201ENST00000325558 RASGRF1Q13972 1273 aa13.43□□□□□ -0.26
PGA3-201ENST00000325558 SPATA5Q8NB90 893 aa13.43□□□□□ -0.26
PGA3-201ENST00000325558 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
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