RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303927.3

CAVIN3-201, Transcript of caveolae associated protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAVIN3, Length 1,174 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3-201ENST00000303927 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.2■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.19■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 AOC2O75106 756 aa25.19■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.19■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 SUCLG2Q96I99 432 aa25.19■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 GGA1Q9UJY5 639 aa25.19■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.19■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 SCN9AQ15858 1988 aa25.18■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 EGFRP00533 1210 aa25.18■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.18■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.18■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 USP48Q86UV5 1035 aa25.18■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.18■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 USP44Q9H0E7 712 aa25.18■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 MAP2K2P36507 400 aa25.17■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.17■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.17■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 XDHP47989 1333 aa25.16■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 G3V3G9 751 aa25.16■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 TRIM27P14373 513 aa25.16■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.16■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.16■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 KAZALD1Q96I82 304 aa25.15■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.15■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.15■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 DLK2Q6UY11 383 aa25.14■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.14■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CAVIN3-201ENST00000303927 PSME4Q14997 1843 aa25.14■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.13■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF609O15014 1411 aa25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 ADM5C9JUS6 153 aa25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 ATP2B4P23634 1241 aa25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.12■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 HUNKP57058 714 aa25.11■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 TSKSQ9UJT2 592 aa25.11■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.1■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 GGA3Q9NZ52 723 aa25.1■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 A0A1B0GUL6 1792 aa25.1■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.09■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 CA12O43570 354 aa25.08■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.08■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.08■■□□□ 1.61
CAVIN3-201ENST00000303927 GNAI3P08754 354 aa25.07■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 CHRNDQ07001 517 aa25.07■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 NOGQ13253 232 aa25.07■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.07■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 SULF1Q8IWU6 871 aa25.07■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 ABHD8Q96I13 439 aa25.07■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 TNNQ9UQP3 1299 aa25.07■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 MED23Q9ULK4 1368 aa25.06■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.06■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 MEIS3Q99687 375 aa25.06■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.06■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 PODNQ7Z5L7 613 aa25.05■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.05■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 USP17L3A6NCW0 530 aa25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 USP17L4A6NCW7 530 aa25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 RGMBQ6NW40 437 aa25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 ZIC5Q96T25 663 aa25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 GMLQ99445 158 aa25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.04■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 USP17L8P0C7I0 530 aa25.03■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 KCNJ4P48050 445 aa25.03■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 SCARF1Q14162 830 aa25.03■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 CDCA5Q96FF9 252 aa25.03■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.03■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 MS4A1P11836 297 aa25.02■■□□□ 1.6
CAVIN3-201ENST00000303927 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CAVIN3-201ENST00000303927 CCDC102AQ96A19 550 aa25■■□□□ 1.59
CAVIN3-201ENST00000303927 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25■■□□□ 1.59
CAVIN3-201ENST00000303927 TAF5LO75529 589 aa24.99■■□□□ 1.59
CAVIN3-201ENST00000303927 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CAVIN3-201ENST00000303927 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.99■■□□□ 1.59
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