RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 ZNF609O15014 1411 aa23.71■■□□□ 1.39
HPS6-201ENST00000299238 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
HPS6-201ENST00000299238 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.71■■□□□ 1.39
HPS6-201ENST00000299238 UVSSAQ2YD98 709 aa23.7■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.7■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 HAUS7Q99871 368 aa23.7■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.7■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.7■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 FUCA2Q9BTY2 467 aa23.68■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa23.68■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 KDM4AO75164 1064 aa23.67■■□□□ 1.38
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HPS6-201ENST00000299238 KLHL34Q8N239 644 aa23.67■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 ITGB4P16144 1822 aa23.67■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 KRT222Q8N1A0 295 aa23.67■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 PDCP20941 246 aa23.66■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 TTC6Q86TZ1 520 aa23.66■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.66■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
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HPS6-201ENST00000299238 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.65■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.65■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 GPR108Q9NPR9 543 aa23.65■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
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HPS6-201ENST00000299238 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 LRRC24Q50LG9 513 aa23.64■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.64■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
HPS6-201ENST00000299238 EYA2O00167 538 aa23.64■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.64■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.64■■□□□ 1.37
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HPS6-201ENST00000299238 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 PALLDQ8WX93 1383 aa23.64■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 KRT85P78386 507 aa23.63■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 CAMK4Q16566 473 aa23.63■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 NEK1Q96PY6 1258 aa23.63■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.63■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.63■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 ELP1O95163 1332 aa23.63■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 CYP21A2P08686 494 aa23.63■■□□□ 1.37
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HPS6-201ENST00000299238 TIMM10P62072 90 aa23.63■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 KMT5BQ4FZB7 885 aa23.63■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.63■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 PIGBQ92521 554 aa23.63■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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HPS6-201ENST00000299238 TCIRG1Q13488 830 aa23.62■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 GTF3C6Q969F1 213 aa23.62■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 BTG4Q9NY30 223 aa23.62■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 CIAO1O76071 339 aa23.62■■□□□ 1.37
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HPS6-201ENST00000299238 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.62■■□□□ 1.37
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HPS6-201ENST00000299238 ATG3Q9NT62 314 aa23.61■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 SPEF2Q9C093 1822 aa23.6■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 PTGS1P23219 599 aa23.6■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 SYCP1Q15431 976 aa23.6■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.6■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 LAMA4Q16363 1823 aa23.59■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 SMTNL1A8MU46 457 aa23.59■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 Q6ZUG5 572 aa23.59■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 DDX11Q96FC9 970 aa23.59■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 A0A1B0GUL7 405 aa23.59■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 LRMPQ12912 555 aa23.59■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.59■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 DISP2A7MBM2 1401 aa23.59■■□□□ 1.37
HPS6-201ENST00000299238 PPFIA3O75145 1194 aa23.58■■□□□ 1.36
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HPS6-201ENST00000299238 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.57■■□□□ 1.36
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HPS6-201ENST00000299238 FOSBP53539 338 aa23.57■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.57■■□□□ 1.36
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HPS6-201ENST00000299238 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.57■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.57■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 TNNT1P13805 278 aa23.57■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 STARD3NLO95772 234 aa23.56■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.56■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.56■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 LRP6O75581 1613 aa23.56■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 A0A0G2JLW4 131 aa23.55■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 CCDC112Q8NEF3 446 aa23.55■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 FAM89AQ96GI7 184 aa23.55■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 TMX1Q9H3N1 280 aa23.55■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.55■■□□□ 1.36
HPS6-201ENST00000299238 TICAM2Q86XR7 235 aa23.55■■□□□ 1.36
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