RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 SP8Q8IXZ3 490 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLIM4O00461 696 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 ILDR2Q71H61 639 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-201ENST00000298838 CHRNA5P30532 468 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 MCAMP43121 646 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.615e-7■■□□□ 12.9
PACSIN3-201ENST00000298838 SCARF1Q14162 830 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC51AQ86UW1 340 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 HIP1O00291 1037 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 BCAMP50895 628 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 GPSM2P81274 684 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 LTBP1Q14766 1721 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 VPS37DQ86XT2 251 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 CNKSR1Q969H4 720 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 SNRKQ9NRH2 765 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 GYG1P46976 350 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP2B4P23634 1241 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 ZAP70P43403 619 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 GGA1Q9UJY5 639 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 RASGRF1Q13972 1273 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 PI16Q6UXB8 463 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 TICAM2Q86XR7 235 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 UFL1O94874 794 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 KLRK1P26718 216 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA5Q8NB90 893 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 SLX4Q8IY92 1834 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 REC8O95072 547 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-201ENST00000298838 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 MYH7P12883 1935 aa25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 SEMA3EO15041 775 aa25.06■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 MPNDQ8N594 471 aa25.06■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 SGSM2O43147 1006 aa25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 TGFB2P61812 414 aa25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 POLLQ9UGP5 575 aa25.05■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 MED23Q9ULK4 1368 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 RAD50Q92878 1312 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 C6orf229H3BNL8 230 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 DPEP1P16444 411 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 DOCK2Q92608 1830 aa25.04■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 OLFM4Q6UX06 510 aa25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 TTLL6Q8N841 843 aa25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0G2JLW4 131 aa25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB22O15209 634 aa25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 PTGER2P43116 358 aa25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM227BQ96M60 508 aa25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 IL25Q9H293 177 aa25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0D9SFI3 127 aa25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PACSIN3-201ENST00000298838 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.01■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.01■■□□□ 1.59
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