RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 USP37Q86T82 979 aa24.06■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.06■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.06■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 CTAGE9A4FU28 777 aa24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 SLC39A6Q13433 755 aa24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 FERMT2Q96AC1 680 aa24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 RTL9Q8NET4 1388 aa24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF4Q96M43 638 aa24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 ASIC1P78348 528 aa24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 SAMM50Q9Y512 469 aa24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.04■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 KRT86O43790 486 aa24.04■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 PRPHP41219 470 aa24.04■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.04■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 IVLP07476 585 aa24.04■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA1Q92805 767 aa24.04■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 DHX58Q96C10 678 aa24.04■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 TIGD1Q96MW7 591 aa24.04■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.03■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 ACTN2P35609 894 aa24.03■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.03■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 NF2P35240 595 aa24.03■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 KIF5AQ12840 1032 aa24.03■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.03■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 NPATQ14207 1427 aa24.03■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 NGLY1Q96IV0 654 aa24.02■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K5Q99683 1374 aa24.02■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 A2MP01023 1474 aa24.02■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 OPA1O60313 960 aa24.02■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 TUBBP07437 444 aa24.02■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 MCM6Q14566 821 aa24.02■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf50Q9HD87 102 aa24.02■■□□□ 1.44
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 APOBRQ0VD83 1088 aa24.01■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 BICDL2A1A5D9 508 aa24.01■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 RFC4P35249 363 aa24.01■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 NAPAP54920 295 aa24.01■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 KRT13P13646 458 aa24.01■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.01■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 NLRP3Q96P20 1036 aa24■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 FERMT1Q9BQL6 677 aa24■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 CARD14Q9BXL6 1004 aa24■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 ATP10BO94823 1461 aa24■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 LMBR1Q8WVP7 490 aa24■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 SEC24BO95487 1268 aa24■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 PTGS1P23219 599 aa24■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 PHACTR3Q96KR7 559 aa24■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC42Q96M95 316 aa24■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 HOMER2Q9NSB8 354 aa24■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.99■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.99■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.99■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 KRT2P35908 639 aa23.99■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 WDR78Q5VTH9 848 aa23.99■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 ST5P78524 1137 aa23.99■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.99■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.99■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 IFNKQ9P0W0 207 aa23.98■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 IKBKGQ9Y6K9 419 aa23.98■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 KRT79Q5XKE5 535 aa23.98■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 DRC1Q96MC2 740 aa23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 IQUBQ8NA54 791 aa23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 TFCP2Q12800 502 aa23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 KRT24Q2M2I5 525 aa23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 SETDB2Q96T68 719 aa23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf163Q5TEZ5 329 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 BICD1Q96G01 975 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC77Q9BR77 488 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 HSPA4P34932 840 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 CHMP4BP1P59074 171 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.96■■□□□ 1.43
CCSAP-201ENST00000284617 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.433e-6■■□□□ 12.1
CCSAP-201ENST00000284617 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms