RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 SDSP20132 328 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 HYPKQ9NX55 129 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 IVLP07476 585 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 KCND1Q9NSA2 647 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 SUFUQ9UMX1 484 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 TCHHQ07283 1943 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.58■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 MCTP2Q6DN12 878 aa25.58■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.58■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.58■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 PDE1AP54750 535 aa25.58■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 REXO1L1PQ8IX06 675 aa25.58■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 CDC25BP30305 580 aa25.57■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 ACTN2P35609 894 aa25.57■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 DDB1Q16531 1140 aa25.57■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 NBPF20Q3BBV1 942 aa25.57■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 PPM1EQ8WY54 764 aa25.57■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 USP16Q9Y5T5 823 aa25.57■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 USP27XA6NNY8 438 aa25.57■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 POLA2Q14181 598 aa25.57■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.681e-6■■■■□ 23
PITX1-201ENST00000265340 CEP89Q96ST8 783 aa25.57■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 OAS2P29728 719 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 BARGINQ6ZT62 677 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 ERC2O15083 957 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 NPHP1O15259 732 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 MYL6BP14649 208 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 CABP4P57796 275 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 TDO2P48775 406 aa25.55■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 TRIM5Q9C035 493 aa25.55■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 SRGAP3O43295 1099 aa25.54■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa25.54■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 LRRC8AQ8IWT6 810 aa25.54■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.54■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 ATP6V1AP38606 617 aa25.54■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.54■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 CCDC93Q567U6 631 aa25.53■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.53■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 ALDH1L1O75891 902 aa25.53■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 CPP00450 1065 aa25.53■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.53■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 LUZP1Q86V48 1076 aa25.53■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.53■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 GLI3P10071 1580 aa25.52■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 TNS2Q63HR2 1409 aa25.52■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 CCDC144BQ3MJ40 725 aa25.52■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa25.52■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.52■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 RAI14Q9P0K7 980 aa25.52■■□□□ 1.68
PITX1-201ENST00000265340 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.51■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.51■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 CCDC189A1A4V9 331 aa25.51■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 RPAINQ86UA6 219 aa25.51■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 ATRNO75882 1429 aa25.5■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 RPS6KA5O75582 802 aa25.5■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 IGKV5-2P06315 115 aa25.5■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 TYRO3Q06418 890 aa25.5■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 E2F4Q16254 413 aa25.5■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 COPS6Q7L5N1 327 aa25.5■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 LINS1Q8NG48 757 aa25.5■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 CBX8Q9HC52 389 aa25.5■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.5■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 MAP2K2P36507 400 aa25.49■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 LEKR1Q6ZMV7 388 aa25.49■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 EP400Q96L91 3159 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 FAM182BQ5T319 152 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 LMAN1P49257 510 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 CORO7P57737 925 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX1-201ENST00000265340 ANAPC15P60006 121 aa25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.5 ms