RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 CNNM2Q9H8M5 875 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN12O43309 604 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 IL2RBP14784 551 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 ATP2B3Q16720 1220 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 CEP135Q66GS9 1140 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 MPHOSPH8Q99549 860 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 IDH1O75874 414 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 TTC6Q86TZ1 520 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 VPS37DQ86XT2 251 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA8AA7E2F4 631 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 SPTLC2O15270 562 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 PTGS1P23219 599 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 KANK3Q6NY19 840 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 LUZP1Q86V48 1076 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 GUCY1B3Q02153 619 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 KLHDC4Q8TBB5 520 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 KRT23Q9C075 422 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 SLC12A7Q9Y666 1083 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 LRRC2Q9BYS8 371 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 NAPBQ9H115 298 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 PEAK1Q9H792 1746 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GUL7 405 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 IARSP41252 1262 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 CHRNA2Q15822 529 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 RASSF8Q8NHQ8 419 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 APPBP2Q92624 585 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 SMARCE1Q969G3 411 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 CHAMP1Q96JM3 812 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 IMPACTQ9P2X3 320 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 MYO1BO43795 1136 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 LARGE1O95461 756 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 TDO2P48775 406 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 TMTC2Q8N394 836 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 UBAC1Q9BSL1 405 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 E7EWF7 191 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 MRVI1Q9Y6F6 885 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 NALCNQ8IZF0 1738 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 YEATS4O95619 227 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 GNAT2P19087 354 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 CACNA1FO60840 1977 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 PDILTQ8N807 584 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 SKILP12757 684 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 LIG1P18858 919 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 CCDC102BQ68D86 513 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 TMEM87BQ96K49 555 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 ALG1Q9BT22 464 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 SYKP43405 635 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB43O43298 467 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 JAK2O60674 1132 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 IGKV5-2P06315 115 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 TXLNAP40222 546 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 TMEM67Q5HYA8 995 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 TMC6Q7Z403 805 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 AOPEPQ8N6M6 819 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 CNNM3Q8NE01 707 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 SNRKQ9NRH2 765 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PQ27 194 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PQ64 194 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PQD8 194 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 BMP15O95972 392 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 TOP1P11387 765 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 HAND2P61296 217 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 RESTQ13127 1097 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 CFAP100Q494V2 611 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 PPFIBP1Q86W92 1011 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 FEZ1Q99689 392 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 MED23Q9ULK4 1368 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 RGPD1P0DJD0 1748 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 ADALQ6DHV7 355 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC3-201ENST00000264345 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
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