RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262643.7

CCNE1-201, Transcript of cyclin E1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNE1, Length 2,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1-201ENST00000262643 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.6■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 MEIS3Q99687 375 aa26.6■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.59■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 A0A1B0GUL6 1792 aa26.58■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 PODNQ7Z5L7 613 aa26.57■■□□□ 1.84
CCNE1-201ENST00000262643 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CCNE1-201ENST00000262643 SHTN1A0MZ66 631 aa26.56■■□□□ 1.84
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CCNE1-201ENST00000262643 LRRC24Q50LG9 513 aa26.55■■□□□ 1.84
CCNE1-201ENST00000262643 MICALL2Q8IY33 904 aa26.55■■□□□ 1.84
CCNE1-201ENST00000262643 COA1Q9GZY4 146 aa26.55■■□□□ 1.84
CCNE1-201ENST00000262643 COG6Q9Y2V7 657 aa26.55■■□□□ 1.84
CCNE1-201ENST00000262643 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.55■■□□□ 1.84
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CCNE1-201ENST00000262643 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.55■■□□□ 1.84
CCNE1-201ENST00000262643 HTRA3P83110 453 aa26.54■■□□□ 1.84
CCNE1-201ENST00000262643 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CCNE1-201ENST00000262643 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.54■■□□□ 1.84
CCNE1-201ENST00000262643 DPF2Q92785 391 aa26.54■■□□□ 1.84
CCNE1-201ENST00000262643 FBXW7Q969H0 707 aa26.54■■□□□ 1.84
CCNE1-201ENST00000262643 GNAI3P08754 354 aa26.53■■□□□ 1.84
CCNE1-201ENST00000262643 USP17L3A6NCW0 530 aa26.53■■□□□ 1.84
CCNE1-201ENST00000262643 USP17L4A6NCW7 530 aa26.53■■□□□ 1.84
CCNE1-201ENST00000262643 H7C1D1 291 aa26.53■■□□□ 1.84
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CCNE1-201ENST00000262643 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
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CCNE1-201ENST00000262643 METTL24Q5JXM2 366 aa26.51■■□□□ 1.83
CCNE1-201ENST00000262643 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CCNE1-201ENST00000262643 PSME4Q14997 1843 aa26.51■■□□□ 1.83
CCNE1-201ENST00000262643 TRPM4Q8TD43 1214 aa26.51■■□□□ 1.83
CCNE1-201ENST00000262643 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.51■■□□□ 1.83
CCNE1-201ENST00000262643 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.5■■□□□ 1.83
CCNE1-201ENST00000262643 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CCNE1-201ENST00000262643 CNTROBQ8N137 903 aa26.5■■□□□ 1.83
CCNE1-201ENST00000262643 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CCNE1-201ENST00000262643 CD209Q9NNX6 404 aa26.49■■□□□ 1.83
CCNE1-201ENST00000262643 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CCNE1-201ENST00000262643 MXD3Q9BW11 206 aa26.49■■□□□ 1.83
CCNE1-201ENST00000262643 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CCNE1-201ENST00000262643 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CCNE1-201ENST00000262643 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
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CCNE1-201ENST00000262643 SIL1Q9H173 461 aa26.48■■□□□ 1.83
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CCNE1-201ENST00000262643 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.48■■□□□ 1.83
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CCNE1-201ENST00000262643 PASKQ96RG2 1323 aa26.45■■□□□ 1.83
CCNE1-201ENST00000262643 PDE8BO95263 885 aa26.45■■□□□ 1.82
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CCNE1-201ENST00000262643 GMLQ99445 158 aa26.44■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 SRGAP3O43295 1099 aa26.44■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 USP17L8P0C7I0 530 aa26.44■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 MS4A1P11836 297 aa26.44■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 ZNF609O15014 1411 aa26.43■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.43■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.43■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 JAG2Q9Y219 1238 aa26.43■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 IL1R1P14778 569 aa26.42■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
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CCNE1-201ENST00000262643 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
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CCNE1-201ENST00000262643 PGAP2Q9UHJ9 254 aa26.4■■□□□ 1.82
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CCNE1-201ENST00000262643 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.39■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.39■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.39■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.39■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 COPRSQ9NQ92 184 aa26.39■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 FBXO3Q9UK99 471 aa26.39■■□□□ 1.82
CCNE1-201ENST00000262643 OGFOD1Q8N543 542 aa26.39■■□□□ 1.81
CCNE1-201ENST00000262643 CREBZFQ9NS37 354 aa26.39■■□□□ 1.81
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