RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 ALG1Q9BT22 464 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 SLC26A6Q9BXS9 759 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 ADCY10Q96PN6 1610 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 RAB3GAP1Q15042 981 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 PNMA2Q9UL42 364 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 PIP4K2BP78356 416 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 CAMK4Q16566 473 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 RUFY3Q7L099 469 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 PAF1Q8N7H5 531 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF165P49910 485 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 IGHDP01880 384 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 CYP7A1P22680 504 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 STAT6P42226 847 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 ZBTB3Q9H5J0 574 aa10.3□□□□□ -0.76
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PTPRB-201ENST00000261266 CCDC174Q6PII3 467 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 TPTE2Q6XPS3 522 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
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PTPRB-201ENST00000261266 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
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PTPRB-201ENST00000261266 BRPF3Q9ULD4 1205 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 KDM5CP41229 1560 aa10.29□□□□□ -0.76
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PTPRB-201ENST00000261266 IFFO1Q0D2I5 559 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 FBXO3Q9UK99 471 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 OPA1O60313 960 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 CEP135Q66GS9 1140 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 NLRP1Q9C000 1473 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 A6NNZ2 444 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 TUBB8Q3ZCM7 444 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 SUPT20HQ8NEM7 779 aa10.28□□□□□ -0.76
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PTPRB-201ENST00000261266 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 C6orf229H3BNL8 230 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 TRIM47Q96LD4 638 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 URI1O94763 535 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 TTC6Q86TZ1 520 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC155Q8N6L0 562 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 MLH3Q9UHC1 1453 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 PRC1O43663 620 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 HSF2BPO75031 334 aa10.27□□□□□ -0.76
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PTPRB-201ENST00000261266 FERMT3Q86UX7 667 aa10.27□□□□□ -0.76
PTPRB-201ENST00000261266 SCLT1Q96NL6 688 aa10.27□□□□□ -0.76
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PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZUG5 572 aa10.27□□□□□ -0.76
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PTPRB-201ENST00000261266 MROH5Q6ZUA9 1318 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 SYCP3Q8IZU3 236 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 DYDC1Q8WWB3 177 aa10.27□□□□□ -0.77
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PTPRB-201ENST00000261266 RRAGBQ5VZM2 374 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
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PTPRB-201ENST00000261266 TET3O43151 1660 aa10.27□□□□□ -0.77
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PTPRB-201ENST00000261266 UBASH3AP57075 661 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 CCT2P78371 535 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 RILPL1Q5EBL4 403 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 KRT79Q5XKE5 535 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 EFCAB6Q5THR3 1501 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 STK11IPQ8N1F8 1099 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 PIBF1Q8WXW3 757 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 BRF1Q92994 677 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 TTC14Q96N46 770 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 SSR1P43307 286 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 C8orf58Q8NAV2 365 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM2Q9UHN6 1383 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 N4BP3O15049 544 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC175P0C221 793 aa10.26□□□□□ -0.77
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