RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257536.11

CCNJL-201, Transcript of cyclin J like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCNJL, Length 1,848 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJL-201ENST00000257536 UBE4AQ14139 1066 aa29.1■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 LTBP1Q14766 1721 aa29.1■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 AOX1Q06278 1338 aa29.1■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 CCDC158Q5M9N0 1113 aa29.1■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.1■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 GGA1Q9UJY5 639 aa29.1■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa29.1■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 C21orf2O43822 256 aa29.09■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 AK9Q5TCS8 1911 aa29.09■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa29.08■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 PHKA1P46020 1223 aa29.08■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 GYG1P46976 350 aa29.08■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 PIM2Q9P1W9 311 aa29.08■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 C6orf229H3BNL8 230 aa29.08■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 MPNDQ8N594 471 aa29.08■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CCNJL-201ENST00000257536 BCAMP50895 628 aa29.07■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 BMP2KLQ5H9B9 411 aa29.07■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 CCDC102BQ68D86 513 aa29.07■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 LEMD3Q9Y2U8 911 aa29.07■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 DUOX1Q9NRD9 1551 aa29.06■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 RILPL2Q969X0 211 aa29.06■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 ATP2B4P23634 1241 aa29.06■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 TBC1D16Q8TBP0 767 aa29.06■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 POLLQ9UGP5 575 aa29.06■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 ATP5JP18859 108 aa29.05■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 TXNRD3Q86VQ6 643 aa29.05■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 VPS37DQ86XT2 251 aa29.05■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 PODXL2Q9NZ53 605 aa29.05■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 SDSP20132 328 aa29.04■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 SNRKQ9NRH2 765 aa29.04■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 SCARF1Q14162 830 aa29.04■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 CAVIN4Q5BKX8 364 aa29.04■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 PI16Q6UXB8 463 aa29.03■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 MYH13Q9UKX3 1938 aa29.02■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 C7orf43Q8WVR3 580 aa29.02■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 RIMBP2O15034 1052 aa29.01■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 BCS1LQ9Y276 419 aa29.01■■■□□ 2.24
CCNJL-201ENST00000257536 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP29.01■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 MCAMP43121 646 aa29■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 AKAP11Q9UKA4 1901 aa29■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 IRS2Q9Y4H2 1338 aa28.99■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 HAUS7Q99871 368 aa28.99■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 GOLIM4O00461 696 aa28.99■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa28.99■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 CCDC93Q567U6 631 aa28.99■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 CNTROBQ8N137 903 aa28.99■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 RASGRF1Q13972 1273 aa28.98■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 ZAP70P43403 619 aa28.97■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 MED23Q9ULK4 1368 aa28.97■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 ZNF804AQ7Z570 1209 aa28.97■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 PAG1Q9NWQ8 432 aa28.97■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 SNED1Q8TER0 1413 aa28.96■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.96■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 FBXO33Q7Z6M2 555 aa28.96■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.95■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 HMG20BQ9P0W2 317 aa28.95■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 JAG2Q9Y219 1238 aa28.95■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
CCNJL-201ENST00000257536 WASHC4Q2M389 1173 aa28.94■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 SPATA5Q8NB90 893 aa28.94■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 EVI5LQ96CN4 794 aa28.94■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 FSD1Q9BTV5 496 aa28.94■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 C8orf34Q49A92 452 aa28.94■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 EYA3Q99504 573 aa28.94■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 SYT17Q9BSW7 474 aa28.93■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 CDC45O75419 566 aa28.92■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 RTKN2Q8IZC4 609 aa28.92■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 DOK7Q18PE1 504 aa28.92■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 SOGA3Q5TF21 947 aa28.92■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa28.91■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 G3V3G9 751 aa28.91■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 AOC3Q16853 763 aa28.91■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.91■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa28.9■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 CD209Q9NNX6 404 aa28.9■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.89■■■□□ 2.22
CCNJL-201ENST00000257536 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms