RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.8■■□□□ 1.56
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CSNK1G2-201ENST00000255641 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
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CSNK1G2-201ENST00000255641 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
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CSNK1G2-201ENST00000255641 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.547e-7■■■■□ 19.4
CSNK1G2-201ENST00000255641 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 STK38Q15208 465 aa24.7■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 E7EWF7 191 aa24.69■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 CAVIN2O95810 425 aa24.69■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 FHOD1Q9Y613 1164 aa24.69■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.68■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIAA1468Q9P260 1216 aa24.68■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.68■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 AIFM3Q96NN9 605 aa24.67■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.67■■□□□ 1.54
CSNK1G2-201ENST00000255641 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
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