RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 PDE8BO95263 885 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 G3V3G9 751 aa24■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 SNAP23O00161 211 aa24■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 APBB1O00213 710 aa24■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 UBE4AQ14139 1066 aa24■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 VGLL2Q8N8G2 317 aa24■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 COL4A5P29400 1685 aa24■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 LRRCC1Q9C099 1032 aa24■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 TFCP2Q12800 502 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 NUCB1Q02818 461 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 YY1P25490 414 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 DOK7Q18PE1 504 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 ECE2O60344 883 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 KLRK1P26718 216 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 SLC5A1P13866 664 aa23.95■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 ATP2B3Q16720 1220 aa23.95■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.95■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.95■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 GPR108Q9NPR9 543 aa23.95■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.95■■□□□ 1.43
HOXD11-201ENST00000249504 FZD9O00144 591 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 LPIN2Q92539 896 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF609O15014 1411 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 FGFR2P21802 821 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 COA1Q9GZY4 146 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 TNNI3KQ59H18 835 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 LNPKQ9C0E8 428 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 YDJCA8MPS7 323 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 PODNQ7Z5L7 613 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 VPS37DQ86XT2 251 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 SCN9AQ15858 1988 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1B0GUL7 405 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 GYG1P46976 350 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 RAD17O75943 681 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 AACSQ86V21 672 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 CD209Q9NNX6 404 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD11-201ENST00000249504 PSME4Q14997 1843 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 GLTPD2A6NH11 291 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 CXCL9Q07325 125 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 TIMM10P62072 90 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 TNIP1Q15025 636 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 FBXW7Q969H0 707 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 BCL11AQ9H165 835 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 PDE4AP27815 886 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 BCAMP50895 628 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 GPC2Q8N158 579 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 PSMD14O00487 310 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 IL1R1P14778 569 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 ADORA1P30542 326 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 GORABQ5T7V8 394 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 XAGE2Q96GT9 111 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 USP17L3A6NCW0 530 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 USP17L4A6NCW7 530 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
HOXD11-201ENST00000249504 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms