RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 EGFRP00533 1210 aa21.64■■□□□ 1.06
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HOXC6-201ENST00000243108 PTPRCP08575 1304 aa21.64■■□□□ 1.05
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HOXC6-201ENST00000243108 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.63■■□□□ 1.05
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HOXC6-201ENST00000243108 G3V3G9 751 aa21.58■■□□□ 1.04
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HOXC6-201ENST00000243108 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.58■■□□□ 1.04
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HOXC6-201ENST00000243108 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.56■■□□□ 1.04
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HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXC6-201ENST00000243108 RASSF10A6NK89 507 aa21.55■■□□□ 1.04
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HOXC6-201ENST00000243108 USP17L3A6NCW0 530 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L4A6NCW7 530 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.54■■□□□ 1.04
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HOXC6-201ENST00000243108 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXC6-201ENST00000243108 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXC6-201ENST00000243108 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HOXC6-201ENST00000243108 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXC6-201ENST00000243108 DACT2Q5SW24 774 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 USP48Q86UV5 1035 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 COA1Q9GZY4 146 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 USP44Q9H0E7 712 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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HOXC6-201ENST00000243108 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 ADM5C9JUS6 153 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L8P0C7I0 530 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 KCNJ4P48050 445 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 CD209Q9NNX6 404 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXC6-201ENST00000243108 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.48■■□□□ 1.03
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