RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051221.12

Ankrd40-202, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd40, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ly6iQ9WU67 134 aa37.62■■■■□ 3.61
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 A0A1W2P7S8 802 aa37.61■■■■□ 3.61
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Usp17lbE9Q9U0 468 aa37.61■■■■□ 3.61
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Mapkapk5O54992 473 aa37.52■■■■□ 3.6
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Psme4Q5SSW2 1843 aa37.49■■■■□ 3.59
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Polr3dQ91WD1 398 aa37.46■■■■□ 3.59
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Psmd14O35593 310 aa37.45■■■■□ 3.59
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Myh13B1AR69 1938 aa37.4■■■■□ 3.58
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Map7O88735 730 aa37.39■■■■□ 3.58
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Myh3P13541 1940 aa37.38■■■■□ 3.57
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 NpcdF8VQB8 469 aa37.38■■■■□ 3.57
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Mxd3Q80US8 206 aa37.38■■■■□ 3.57
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Dcdc2bF7BCK0 340 aa37.37■■■■□ 3.57
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Supt16hQ920B9 1047 aa37.37■■■■□ 3.57
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