RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637657.1

PCCA-215, Transcript of propionyl-CoA carboxylase subunit alpha, human

TSL 5

Gene PCCA, Length 2,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCCA-215	ENST00000637657	THEM4	Q5T1C6	240 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	FAM219A	Q8IW50	185 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		11.65	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	PPP5D1	E7EU14	171 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	OPN1MW	P04001	364 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	TK1	P04183	234 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	OR5H8	P0DN80	308 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	COTL1	Q14019	142 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	ODF4	Q2M2E3	257 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	CARF	Q8N187	725 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	SPACA7	Q96KW9	195 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	VAX2	Q9UIW0	290 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	DAPP1	Q9UN19	280 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	OR1A2	Q9Y585	309 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	CLDN34	H7C241	214 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657		K7N7A8	449 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	CCKAR	P32238	428 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	NPY4R	P50391	375 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	EMD	P50402	254 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	MMP16	P51512	607 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	CCR4	P51679	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	ERVFRD-1	P60508	538 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	ZNF266	Q14584	549 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	IL13RA2	Q14627	380 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	ARL6IP1	Q15041	203 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	ZNF429	Q86V71	674 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	ACY3	Q96HD9	319 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	TSSK2	Q96PF2	358 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	OR2M4	Q96R27	311 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657		R4GMQ9	66 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	HSD17B6	O14756	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	HBE1	P02100	147 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	CYBA	P13498	195 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	CD200	P41217	278 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	ERVFC1-1	P60608	527 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	QRFP	P83859	136 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	CLN3	Q13286	438 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	FRZB	Q92765	325 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	TAAR8	Q969N4	342 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	XKRY	O14609	159 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	RAMP1	O60894	148 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	MSX1	P28360	303 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	OR3A2	P47893	321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	TDGF1P3	P51864	188 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	ENPP2	Q13822	863 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	IRF7	Q92985	503 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	NKD1	Q969G9	470 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	FGGY	Q96C11	551 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	MMP25	Q9NPA2	562 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	LNP1	A1A4G5	178 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	SPINT1	O43278	529 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	OR6A2	O95222	327 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	GPR75	O95800	540 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PCCA-215	ENST00000637657	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55

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