RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CADP27708 2225 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1B0GTI1 187 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PPW3 197 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PLPP2O43688 288 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 DHRS3O75911 302 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 RAC2P15153 192 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SELEP16581 610 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CPEP16870 476 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ACHEP22303 614 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SSTR2P30874 369 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TTKP33981 857 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 GSK3AP49840 483 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SELENOVP59797 346 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TPBGQ13641 420 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MUC15Q8N387 334 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR13C3Q8NGS6 347 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR10AC1Q8NH08 325 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MUL1Q969V5 352 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 HAVCR1Q96D42 359 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 C14orf79Q96F83 325 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TMED9Q9BVK6 235 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 HHLA2Q9UM44 414 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PIGLQ9Y2B2 252 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 A6NIN4 97 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CD300LBA8K4G0 201 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 B9A039 149 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CCRL2O00421 344 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 LMX1BO60663 402 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-13P01766 116 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CD1AP06126 327 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OCM2P0CE71 109 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 FAHP16930 419 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF12P17014 697 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF20P17024 532 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 KITLGP21583 273 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CCL1P22362 96 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ACKR3P25106 362 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 LIPAP38571 399 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ALDH3B1P43353 468 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MAGEB1P43366 347 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MAP2K3P46734 347 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SOX2P48431 317 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 EVX1P49640 407 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 RPS25P62851 125 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TNK1Q13470 666 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 GPR50Q13585 617 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR8B8Q15620 311 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 EFNB3Q15768 340 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SSX1Q16384 188 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PHC2Q8IXK0 858 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF611Q8N823 705 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 GPR148Q8TDV2 347 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM203Q969S6 136 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SCOCQ9UIL1 159 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ENPP5Q9UJA9 477 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 DHDHQ9UQ10 334 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 V9GYS6 101 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.27□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PLSCR5A0PG75 271 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SOD3P08294 240 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 DANCRP0C864 163 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 NAT2P11245 290 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PRF1P14222 555 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CD53P19397 219 aa7.27□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CA6P23280 308 aa7.27□□□□□ -1.25
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