RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616247.4

LMO3-235, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 3,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-235ENST00000616247 C5orf66Q9H5L9 145 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CYP8B1Q9UNU6 501 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CDH23Q9H251 3354 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CDRT15L2A8MXV6 281 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 NPIPB9F8W1W9 429 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 TMEM127O75204 238 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 VSIG8P0DPA2 414 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 PNMTP11086 282 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 KLK2P20151 261 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SULT1A2P50226 295 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 P2RY4P51582 365 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SNU13P55769 128 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SCAND1P57086 179 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 PPP1CAP62136 330 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 GLO1Q04760 184 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CEBPEQ15744 281 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ALG11Q2TAA5 492 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 FAM78AQ5JUQ0 283 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 PLXDC2Q6UX71 529 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SPNS3Q6ZMD2 512 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SUMF1Q8NBK3 374 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 OR51T1Q8NGJ9 327 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 MRGPRFQ96AM1 343 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 C14orf144Q96I85 54 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SMIM8Q96KF7 97 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 DEFB118Q96PH6 123 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ATG101Q9BSB4 218 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 EMC6Q9BV81 110 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 FOXQ1Q9C009 403 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SLC17A5Q9NRA2 495 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 HIF3AQ9Y2N7 669 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 C2orf72A6NCS6 295 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ZNF587BE7ETH6 402 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CLDN4O14493 209 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 TCAPO15273 167 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SOX15O60248 233 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 RAMP1O60894 148 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 NXPH3O95157 252 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 TRGC2P03986 189 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CD5P06127 495 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 HEXBP07686 556 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 HTR5AP47898 357 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 RBP2P50120 134 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 TLE1Q04724 770 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 NPSR1Q6W5P4 371 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 DNM1P46Q6ZS02 220 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 RNF144BQ7Z419 303 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SLC43A2Q8N370 569 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ERGIC1Q969X5 290 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 APOOQ9BUR5 198 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 OPA3Q9H6K4 179 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 C19orf12Q9NSK7 152 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 RFNGQ9Y644 331 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SMCO3A2RU48 225 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 PRSS37A4D1T9 235 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ZNF264O43296 627 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 F10P00742 488 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 IL2RAP01589 272 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SLC35E2P0CK97 266 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 HKR1P10072 659 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 FOLR2P14207 255 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 DDTP30046 118 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 GJA4P35212 333 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 DRD3P35462 400 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 IGFALSP35858 605 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 C1orf61Q13536 156 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 TSPO2Q5TGU0 170 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 BTNL8Q6UX41 500 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 LRP11Q86VZ4 500 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SULF2Q8IWU5 870 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 CA13Q8N1Q1 262 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO3-235ENST00000616247 SLC22A24Q8N4F4 322 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms