RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 KCNJ10P78508 379 aa9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 P2RY14Q15391 338 aa9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 C12orf73Q69YU5 71 aa9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 OR4F5Q8NH21 305 aa9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 CMTM7Q96FZ5 175 aa9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 CMTM3Q96MX0 182 aa9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 VSTM2LQ96N03 204 aa9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 NIT2Q9NQR4 276 aa9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 PRODH2Q9UF12 536 aa9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 MIOXQ9UGB7 285 aa9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 GPR160Q9UJ42 338 aa9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 VDAC3Q9Y277 283 aa9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 SERTM1A2A2V5 107 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 CLPSL1A2RUU4 121 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 ANXA2P2A6NMY6 339 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 PLPP2O43688 288 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 TMEM127O75204 238 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 KRT33AO76009 404 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 NDUFA7O95182 113 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 MPZL1O95297 269 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 SERPINA3P01011 423 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 HIST1H2ABP04908 130 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 SLC2A1P11166 492 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 EPB42P16452 691 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 CXCL2P19875 107 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 NPR2P20594 1047 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 VAMP1P23763 118 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 PCGF2P35227 344 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 BSGP35613 385 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 PITPNBP48739 271 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 MTNR1BP49286 362 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 XKP51811 444 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 CARD18P57730 90 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 LRRC74AQ0VAA2 488 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 GABRA6Q16445 453 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 SPANXN4Q5MJ08 99 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 MOB3CQ70IA8 216 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 FAM122BQ7Z309 247 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 OAFQ86UD1 273 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 RNF175Q8N4F7 328 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 OR8J1Q8NGP2 316 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 METTL6Q8TCB7 284 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 HIST1H2ACQ93077 130 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 RGMAQ96B86 450 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 ELP4Q96EB1 424 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 GPA33Q99795 319 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 AMBNQ9NP70 447 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 NUDT15Q9NV35 164 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 OARD1Q9Y530 152 aa9.97□□□□□ -0.81
HCG18-241ENST00000602290 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 C5orf58C9J3I9 102 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 LGALS8O00214 317 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 SSNA1O43805 119 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ENTPD6O75354 484 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 GADD45GO95257 159 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R3DO95685 299 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 OPN1MWP04001 364 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 HLA-DPB1P04440 258 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 FCER2P06734 321 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ITGA5P08648 1049 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 CAPZA1P52907 286 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 TAS2R60P59551 318 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ZP1P60852 638 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 GMFBP60983 142 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 DEFA5Q01523 94 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 MPPED2Q15777 294 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 SGCAQ16586 387 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 PLPPR5Q32ZL2 321 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 DCAF12L2Q5VW00 463 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 C22orf42Q6IC83 251 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ACSM5Q6NUN0 579 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 TMUB2Q71RG4 321 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 OR4N2Q8NGD1 307 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 OR4K14Q8NGD5 310 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 POC1BQ8TC44 478 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 DUSP19Q8WTR2 217 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 ELMOD3Q96FG2 381 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-241ENST00000602290 EGFL8Q99944 293 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms