RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589537.1

NFIC-208, Transcript of nuclear factor I C, human

TSL 2

Gene NFIC, Length 977 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIC-208	ENST00000589537	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	TRIM77	I1YAP6	450 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	TIPRL	O75663	272 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	VENTX	O95231	258 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	FCGR1A	P12314	374 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PITPNB	P48739	271 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	NPY4R	P50391	375 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	CRISP1	P54107	249 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	FAM3A	P98173	230 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	SNAPC1	Q16533	368 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	THEM6	Q8WUY1	208 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	SGK3	Q96BR1	496 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PGAM5	Q96HS1	289 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	CLN8	Q9UBY8	286 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	C5orf63	A6NC05	138 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	LGALS8	O00214	317 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	SELENOF	O60613	162 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF205	O95201	554 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	SLC2A5	P22732	501 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	GNAL	P38405	381 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	MPPED2	Q15777	294 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	ATP6AP1	Q15904	470 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	AMELY	Q99218	206 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	FBN3	Q75N90	2809 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	ACOD1	A6NK06	481 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537		A6NLC8	198 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537		G3V2T6	193 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	ALOX5AP	P20292	161 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	ANOS1	P23352	680 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	FAS	P25445	335 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	GSK3A	P49840	483 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	IL5RA	Q01344	420 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	PAX2	Q02962	417 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	PAX8	Q06710	450 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	APOF	Q13790	326 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	OR8B8	Q15620	311 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	FAM201A	Q5SY85	155 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	KRT84	Q9NSB2	600 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	OOEP	A6NGQ2	149 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	GRP	P07492	148 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	DCTD	P32321	178 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	PSMB10	P40306	273 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	DAP	P51397	102 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	CD276	Q5ZPR3	534 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	MNT	Q99583	582 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	TEAD3	Q99594	435 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	SLC6A7	Q99884	636 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	MICU1	Q9BPX6	476 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	BRD7	Q9NPI1	651 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF254	O75437	659 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	MRO	Q9BYG7	248 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	LRP12	Q9Y561	859 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NFIC-208	ENST00000589537		A0A0U1RQV5	110 aa		13.85	□□□□□ -0.19

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