RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 GFRALQ6UXV0 394 aa19.75■□□□□ 0.75
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT74Q7RTS7 529 aa19.75■□□□□ 0.75
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CAPNS1-207ENST00000589146 NAXEQ8NCW5 288 aa19.75■□□□□ 0.75
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CAPNS1-207ENST00000589146 OR51D1Q8NGF3 324 aa19.75■□□□□ 0.75
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CAPNS1-207ENST00000589146 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
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CAPNS1-207ENST00000589146 XRCC3O43542 346 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV3-15P01624 115 aa19.69■□□□□ 0.74
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CAPNS1-207ENST00000589146 CCL2P13500 99 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-207ENST00000589146 CCNOP22674 350 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-207ENST00000589146 CDK2P24941 298 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-207ENST00000589146 OPRM1P35372 400 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-207ENST00000589146 WNT5AP41221 380 aa19.69■□□□□ 0.74
CAPNS1-207ENST00000589146 ALDH3B1P43353 468 aa19.69■□□□□ 0.74
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