RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 IGHG1P01857 330 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 MT-ND4P03905 459 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 MAS1P04201 325 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 ALDOBP05062 364 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 GIMD1P0DJR0 217 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 FGF5P12034 268 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 GABRA1P14867 456 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 M6PRP20645 277 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 CDK2P24941 298 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 MPZP25189 248 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 MST1P26927 711 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 LAP3P28838 519 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 BDKRB2P30411 391 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 CCKARP32238 428 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 BTCP35070 178 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 THBS4P35443 961 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 CBX5P45973 191 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 SOX2P48431 317 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 SRP9P49458 86 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 LINC00205P59089 165 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRM-215ENST00000583289 CYCSP99999 105 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 CFHR3Q02985 330 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRM-215ENST00000583289 TAF13Q15543 124 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 GRK1Q15835 563 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 MS4A18Q3C1V0 323 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 PCGF3Q3KNV8 242 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 ACTBL2Q562R1 376 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 WDR38Q5JTN6 314 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 LYSMD4Q5XG99 296 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 FAM166AQ6J272 317 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 C3orf33Q6P1S2 294 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 C11orf88Q6PI97 169 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 TEX261Q6UWH6 196 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 IL20RBQ6UXL0 311 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRM-215ENST00000583289 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRM-215ENST00000583289 ELMOD2Q8IZ81 293 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 PRSS35Q8N3Z0 413 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 C9orf62Q8N4C0 152 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 SLC22A24Q8N4F4 322 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRM-215ENST00000583289 ZNF680Q8NEM1 530 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 SLC26A10Q8NG04 563 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 OR11G2Q8NGC1 345 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRM-215ENST00000583289 OR13C3Q8NGS6 347 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRM-215ENST00000583289 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
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PTPRM-215ENST00000583289 ZNRF4Q8WWF5 429 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRM-215ENST00000583289 PNPLA2Q96AD5 504 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRM-215ENST00000583289 FAHD2AQ96GK7 314 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 OXGR1Q96P68 337 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 TSSK2Q96PF2 358 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRM-215ENST00000583289 METTL7AQ9H8H3 244 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRM-215ENST00000583289 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 A0A0D9SG52 128 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 A0A1B0GVC2 190 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 CPED1A4D0V7 1026 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 A6NIN4 97 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PTPRM-215ENST00000583289 C9J4A7 227 aa3.98□□□□□ -1.77
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