RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	UBE2E3	Q969T4	207 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	NRBF2	Q96F24	287 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TPD52L3	Q96J77	140 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TECTB	Q96PL2	329 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	EPYC	Q99645	322 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	REEP4	Q9H6H4	257 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TUBA4B	Q9H853	241 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	BRF2	Q9HAW0	419 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	IL19	Q9UHD0	177 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	BAG5	Q9UL15	447 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1W2PQD3	144 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	PSMB11	A5LHX3	300 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	IMPA2	O14732	288 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	RGS10	O43665	173 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	TMPRSS11D	O60235	418 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	OR10H3	O60404	316 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	FCMR	O60667	390 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SLC43A1	O75387	559 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	KLK1	P06870	262 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	IL3	P08700	152 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GABRB1	P18505	474 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	NTS	P30990	170 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	RRM2	P31350	389 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GGT2	P36268	569 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	HPCAL1	P37235	193 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	OR1E2	P47887	323 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GSS	P48637	474 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	DYNLT3	P51808	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CRISP3	P54108	245 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	KRTAP10-2	P60368	255 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CXCR4	P61073	352 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ERVS71-1	P61550	626 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	VBP1	P61758	197 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	NCS1	P62166	190 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GLO1	Q04760	184 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	C2orf80	Q0P641	193 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	KLRD1	Q13241	179 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SCARB2	Q14108	478 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	IRF3	Q14653	427 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	MAPK11	Q15759	364 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	DEFB136	Q30KP8	78 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SPIN4	Q56A73	249 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772		Q6ZRM9	215 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	AAED1	Q7RTV5	226 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM219	Q86XT9	240 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	METTL4	Q8N3J2	472 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	SETD9	Q8NE22	299 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	LZIC	Q8WZA0	190 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	GGH	Q92820	318 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	FEV	Q99581	238 aa		3.77	□□□□□ -1.81
MSI2-216	ENST00000582772	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		3.77	□□□□□ -1.81

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