RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM229BQ8NBD8 167 aa19.27■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 OR8D4Q8NGM9 314 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRM-211ENST00000580170 SLC39A7Q92504 469 aa19.24■□□□□ 0.67
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PTPRM-211ENST00000580170 MENTQ9BUN1 341 aa19.24■□□□□ 0.67
PTPRM-211ENST00000580170 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
PTPRM-211ENST00000580170 POMT1Q9Y6A1 747 aa19.23■□□□□ 0.67
PTPRM-211ENST00000580170 OR2W5A6NFC9 320 aa19.23■□□□□ 0.67
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