RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572680.1

NEURL4-208, Transcript of neuralized E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene NEURL4, Length 819 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEURL4-208	ENST00000572680	ITFG2	Q969R8	447 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	APOL4	Q9BPW4	351 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	FAM206A	Q9NX38	181 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		12.82	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680		A0A0U1RQV5	110 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	PRR32	B1ATL7	298 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	FAM157A	C9JC47	383 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	MPZL2	O60487	215 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	IGHV2-5	P01817	119 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	MSMB	P08118	114 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	PCMT1	P22061	227 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	GNAL	P38405	381 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	MTNR1A	P48039	350 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	BTG1	P62324	171 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	OR8B8	Q15620	311 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	OCLN	Q16625	522 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	SPIC	Q8N5J4	248 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	OR8S1	Q8NH09	359 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	OR51F2	Q8NH61	342 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	RDH12	Q96NR8	316 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	TBX5	Q99593	518 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	C8orf4	Q9NR00	106 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		12.81	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	ENTPD6	O75354	484 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	APOL3	O95236	402 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	KRT8	P05787	483 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	HNF1A	P20823	631 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	MAP2K3	P46734	347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	RCN1	Q15293	331 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	COMMD2	Q86X83	199 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680		Q8TCH9	128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	LYZL4	Q96KX0	146 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	BEX2	Q9BXY8	128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	ABCB9	Q9NP78	766 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		12.8	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	SLC16A6	O15403	523 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	FAM20B	O75063	409 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	GRP	P07492	148 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	ATP6V1B1	P15313	513 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	PMEL	P40967	661 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	IL5RA	Q01344	420 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	ZMYND11	Q15326	602 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	MPPED2	Q15777	294 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	SSX6	Q7RTT6	188 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	TMEM186	Q96B77	213 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	RNFT2	Q96EX2	444 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680		Q96MT0	163 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680		R4GMQ9	66 aa		12.79	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	NF1	P21359	2839 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	METTL15	A6NJ78	407 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680		A6NLC8	198 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	PPIAL4D	F5H284	164 aa		12.78	□□□□□ -0.36
NEURL4-208	ENST00000572680	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms