RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 TEAD3Q99594 435 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 TEX12Q9BXU0 123 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 RGCCQ9H4X1 137 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 NIPAL2Q9H841 368 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 SP140LQ9H930 580 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 OPN4Q9UHM6 478 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 GGT3PA6NGU5 568 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 ACOD1A6NK06 481 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 LRRC30A6NM36 301 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 G3V2T6 193 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRKYO43930 277 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM20BO75063 409 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 H2BFMP0C1H6 154 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 FCGR1AP12314 374 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF12P17014 697 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 CA6P23280 308 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 HSD11B1P28845 292 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 EPHA2P29317 976 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 DCTDP32321 178 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 PSMB10P40306 273 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 LCN2P80188 198 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 ROM1Q03395 351 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR8G1Q15617 311 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR8B8Q15620 311 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 MPPED2Q15777 294 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 SNAPC1Q16533 368 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 C12orf73Q69YU5 71 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 USP43Q70EL4 1123 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 SPATC1Q76KD6 591 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 ITFG2Q969R8 447 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 OTULINQ96BN8 352 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 MMP26Q9NRE1 261 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 MIOXQ9UGB7 285 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.2□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRR32B1ATL7 298 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 E9PQ18 207 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 LGALS8O00214 317 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 TBX1O43435 398 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 TCF21O43680 179 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 LHBP01229 141 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGLV3-1P01715 115 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 ADRA2CP18825 462 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 CFHR2P36980 270 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 ACTR3P61158 418 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 PAX8Q06710 450 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 MZT1Q08AG7 82 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF154Q13106 437 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 SCGB2A2Q13296 93 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 APOFQ13790 326 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 TIGD6Q17RP2 521 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM201AQ5SY85 155 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 LIPNQ5VXI9 398 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 FAM57BQ71RH2 274 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 NANPQ8TBE9 248 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM163Q8TC26 289 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 THEM6Q8WUY1 208 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
UBE2CP4-201ENST00000561405 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms