RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559948.5

PSMA4-216, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSMA4, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-216ENST00000559948 DUX4Q9UBX2 424 aa7.25□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 V9GYQ6 96 aa7.25□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 GGT3PA6NGU5 568 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 KRT36O76013 467 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 FABP3P05413 133 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 SLC2A1P11166 492 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 RRM2P31350 389 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 IFNGR2P38484 337 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 DDOSTP39656 456 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 TGM4P49221 684 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 PRKXP51817 358 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 SPIBQ01892 262 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 PDCD1Q15116 288 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 OR8B8Q15620 311 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 TAF9Q16594 264 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 CDONQ4KMG0 1287 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 KLHL12Q53G59 568 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 LINC01590Q5TEZ4 76 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 LNX2Q8N448 690 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 OR4C15Q8NGM1 316 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 OR2T4Q8NH00 348 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 TNFRSF14Q92956 283 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 LHX4Q969G2 390 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 SLAMF6Q96DU3 332 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 SEH1LQ96EE3 360 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 CDRT15Q96T59 188 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 TRIM15Q9C019 465 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 RNF114Q9Y508 228 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.24□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 ARPC2O15144 300 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 GPR137BO60478 399 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 CRYBA1P05813 215 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 GYPBP06028 91 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 CLUP10909 449 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 FMO3P31513 532 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 MAGEA2P43356 314 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 SLC25A1P53007 311 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 CRMP1Q14194 572 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 WDR82Q6UXN9 313 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 Q6ZSV7 163 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 Q8N7P7 452 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 PROKR2Q8NFJ6 384 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 OR9Q2Q8NGE9 314 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 CCL13Q99616 98 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 TLNRD1Q9H1K6 362 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 MMP27Q9H306 513 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 C16orf95Q9H693 158 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 CENPMQ9NSP4 180 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 KPTNQ9Y664 436 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.23□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 DHRS12A0PJE2 317 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 ACOT8O14734 319 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 CDIPTO14735 213 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 SNX3O60493 162 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 GMNNO75496 209 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 TSPAN9O75954 239 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 SPI1P17947 270 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 ENTPD1P49961 510 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 DLX1P56177 255 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 CSNK2BP67870 215 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 MICBQ29980 383 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 WDR38Q5JTN6 314 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 PGAM4Q8N0Y7 254 aa7.22□□□□□ -1.25
PSMA4-216ENST00000559948 NPRL2Q8WTW4 380 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms