RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559834.1

HDDC3-204, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene HDDC3, Length 1,076 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-204ENST00000559834 GSSP48637 474 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 PRKXP51817 358 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 KRTAP10-3P60369 221 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 POU4F2Q12837 409 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 TSPAN31Q12999 210 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 SNCBQ16143 134 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 Q6ZSV7 163 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 LNX2Q8N448 690 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 FAM86B1Q8N7N1 296 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 LRRC29Q8WV35 223 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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HDDC3-204ENST00000559834 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 CD300AQ9UGN4 299 aa7.56□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 C5orf63A6NC05 138 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 TVP23AA6NH52 213 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 TBX1O43435 398 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 PAHP00439 452 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 FABP3P05413 133 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 SPARCP09486 303 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 CSF1P09603 554 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 GNALP38405 381 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 ENTPD1P49961 510 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 BLVRAP53004 296 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 TEX30Q5JUR7 227 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 LINC00471Q8N535 108 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 DTX3Q8N9I9 347 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 OR5R1Q8NH85 324 aa7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 SPSB4Q96A44 273 aa7.55□□□□□ -1.2
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HDDC3-204ENST00000559834 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 ZNF878C9JN71 531 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 NPFFO15130 113 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 ATP8B1O43520 1251 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 SASH3O75995 380 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 SLC2A1P11166 492 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 HSD11B1P28845 292 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 PRDX6P30041 224 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 RRM2P31350 389 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 TGM4P49221 684 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 HMGA2P52926 109 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 FAM3AP98173 230 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 IL5RAQ01344 420 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 BLMHQ13867 455 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 PCK2Q16822 640 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 TIGD6Q17RP2 521 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 WDR38Q5JTN6 314 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 Q6ZTK2 550 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.54□□□□□ -1.2
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HDDC3-204ENST00000559834 FTMTQ8N4E7 242 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.54□□□□□ -1.2
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HDDC3-204ENST00000559834 SGK3Q96BR1 496 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 MED30Q96HR3 178 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 MICU1Q9BPX6 476 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 IL1RAPQ9NPH3 570 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 IL20Q9NYY1 176 aa7.54□□□□□ -1.2
HDDC3-204ENST00000559834 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.54□□□□□ -1.2
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