RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 CSPG4Q6UVK1 2322 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 CLDN25C9JDP6 229 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 RPP14O95059 124 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 PNPP00491 289 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 IGHA1P01876 353 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 HLA-DPB1P04440 258 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 USF1P22415 310 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 CA6P23280 308 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 OR8G1Q15617 311 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 CDONQ4KMG0 1287 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 LIPNQ5VXI9 398 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 BIVMQ86UB2 503 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 KLBQ86Z14 1044 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ITLN1Q8WWA0 313 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 TFAP2CQ92754 450 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ITFG2Q969R8 447 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 INPP5EQ9NRR6 644 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 SNX5Q9Y5X3 404 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 DOCK11Q5JSL3 2073 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A096LNT2 108 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 IRGMA1A4Y4 181 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 F5H5P2 479 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 H0YL77 283 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 GMDSO60547 372 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 TTRP02766 147 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 TACSTD2P09758 323 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM33P57088 247 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC3A1Q07837 685 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 MEGF10Q96KG7 1140 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 LYZL4Q96KX0 146 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 SIGLEC11Q96RL6 698 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ACOXLQ9NUZ1 547 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 OR52A1Q9UKL2 312 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 PPIHO43447 177 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM20BO75063 409 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 GNALP38405 381 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 TP53I3Q53FA7 332 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 SPRNQ5BIV9 151 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ELMOD2Q8IZ81 293 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 OR51E1Q8TCB6 317 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 CCL17Q92583 94 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 TIMD4Q96H15 378 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ALG8Q9BVK2 526 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 G6PC2Q9NQR9 355 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 GPR84Q9NQS5 396 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 MYRFQ9Y2G1 1151 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 CACNG2Q9Y698 323 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 IGLV3-1P01715 115 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP6V1B1P15313 513 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ACKR3P25106 362 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 CD200P41217 278 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 MAP2K3P46734 347 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 HSPA13P48723 471 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 MZT1Q08AG7 82 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 GALEQ14376 348 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 C6orf52Q5T4I8 152 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 THAP5Q7Z6K1 395 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 CATSPERDQ86XM0 798 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 SPERTQ8NA61 448 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 RORBQ92753 470 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 JAM3Q9BX67 310 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 GCM1Q9NP62 436 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ABCB9Q9NP78 766 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 IFNL4K9M1U5 179 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 DHRS3O75911 302 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 GATA4P43694 442 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 CHN2P52757 468 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 LHFPL3Q86UP9 236 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 SYS1Q8N2H4 156 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 OR8S1Q8NH09 359 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 FBLIM1Q8WUP2 373 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 C4orf36Q96KX1 117 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM106BQ9NUM4 274 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 C14orf119Q9NWQ9 140 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 ERVK13-1Q9NX77 482 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 TREM2Q9NZC2 230 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-208ENST00000558954 MTORP42345 2549 aa15.96■□□□□ 0.14
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms