RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 TRIM36Q9NQ86 728 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SNTG1Q9NSN8 517 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 ENPP4Q9Y6X5 453 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 OR6C68A6NDL8 312 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 BBIP1A8MTZ0 92 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 NPPAP01160 153 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 VSIG10L2P0DP72 767 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SAA4P35542 130 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SLC36A3Q495N2 470 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 COQ5Q5HYK3 327 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 METTL21CQ5VZV1 264 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 KLHDC1Q8N7A1 406 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 FANK1Q8TC84 345 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 FAM162AQ96A26 154 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SAR1AQ9NR31 198 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 FBLN5Q9UBX5 448 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 BHLHE40O14503 412 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 GPR37O15354 613 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 AMY2BP19961 511 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 DPY19L4Q7Z388 723 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SLC15A3Q8IY34 581 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 OR51L1Q8NGJ5 315 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 OR8S1Q8NH09 359 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 ZNRF4Q8WWF5 429 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SGCDQ92629 289 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SPTSSAQ969W0 71 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 IFT27Q9BW83 186 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 OR52D1Q9H346 318 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 KAAG1Q9UBP8 84 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 NME4O00746 187 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 TBX1O43435 398 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 NDUFB3O43676 98 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 ZNF823P16415 610 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 EFNB2P52799 333 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 LOXL3P58215 753 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 MAPRE2Q15555 327 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 MICBQ29980 383 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 ZBTB37Q5TC79 503 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 CMTM4Q8IZR5 234 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 GALNT4Q8N4A0 578 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 CYB561A3Q8NBI2 242 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 PLPP7Q8NBV4 271 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 TNFRSF14Q92956 283 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 DCTN5Q9BTE1 182 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 ANKRD19PQ9H560 264 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 CENPMQ9NSP4 180 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 C14orf119Q9NWQ9 140 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 CAPN7Q9Y6W3 813 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 V9GYQ6 96 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 COL7A1Q02388 2944 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 NOTCH3Q9UM47 2321 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PRQ8 180 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 NOS3P29474 1203 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SLC6A6P31641 620 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SLC7A2P52569 658 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 GUCA2AQ02747 115 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 DGCR6Q14129 220 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 WDR82Q6UXN9 313 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 ZBTB46Q86UZ6 589 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SPERTQ8NA61 448 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 OR1M1Q8NGA1 313 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 OR5R1Q8NH85 324 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 NPRL2Q8WTW4 380 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SSX3Q99909 188 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 COPS4Q9BT78 406 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 WDR13Q9H1Z4 485 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 NDUFAF4Q9P032 175 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 ZNF391Q9UJN7 358 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 CDIPTO14735 213 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 POU1F1P28069 291 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 GSK3BP49841 420 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 TAF13Q15543 124 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 DCXRQ7Z4W1 244 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 FAM86B1Q8N7N1 296 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 CLPTM1LQ96KA5 538 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 SIKE1Q9BRV8 207 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 MMP28Q9H239 520 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PQ09 198 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 SPARCP09486 303 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 VSIG8P0DPA2 414 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 CD28P10747 220 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CS-227ENST00000551441 NDUFB7P17568 137 aa13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms