RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 CYSLTR2Q9NS75 346 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ENOPH1Q9UHY7 261 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 CACNG2Q9Y698 323 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 H0YL77 283 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PSMD9O00233 223 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PPIHO43447 177 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ALPLP05186 524 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 LYNP07948 512 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 H2BFMP0C1H6 154 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ACHEP22303 614 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 GIFP27352 417 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 CX3CR1P49238 355 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ALDH3A2P51648 485 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 GRB2P62993 217 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ZNF92Q03936 586 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 MALLQ13021 153 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 CDK5R2Q13319 367 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 RIN1Q13671 783 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 TRIP10Q15642 601 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ZSCAN26Q16670 478 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 GLYATL3Q5SZD4 288 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 AADACL4Q5VUY2 407 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 LRRN1Q6UXK5 716 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PGAP1Q75T13 922 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 SLC16A9Q7RTY1 509 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 C3orf56Q8N813 242 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ZNF540Q8NDQ6 660 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 OR8G5Q8NG78 346 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 RNF133Q8WVZ7 376 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 CCL17Q92583 94 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 STMN2Q93045 179 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 GABARAPL3Q9BY60 117 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 TTTY10Q9BZA0 68 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 USE1Q9NZ43 259 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 LAMP5Q9UJQ1 280 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ORC6Q9Y5N6 252 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 A0A0G2JK05 382 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 WNT9BO14905 357 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 SHOXO15266 292 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 RP2O75695 350 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 HLA-DPB1P04440 258 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 ALOX5APP20292 161 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 OPRL1P41146 370 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 CRYBB2P43320 205 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 GZMKP49863 264 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 RAD23AP54725 363 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 TMEM33P57088 247 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 DEFA6Q01524 100 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 MVKQ03426 396 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 ZMAT1Q5H9K5 638 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 AVPI1Q5T686 147 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 LCN1P1Q5VSP4 162 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 FAM57BQ71RH2 274 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 KRT77Q7Z794 578 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 OR10AD1Q8NGE0 317 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 OR13G1Q8NGZ3 307 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 EME1Q96AY2 570 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 ELMOD3Q96FG2 381 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 YIPF3Q9GZM5 350 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 EGLN1Q9GZT9 426 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 TOR3AQ9H497 397 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 AASSQ9UDR5 926 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 COPS3Q9UNS2 423 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 NOTCH1P46531 2555 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 GGT3PA6NGU5 568 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 CD300LBA8K4G0 201 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 APOL3O95236 402 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 ADH4P08319 380 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 SELEP16581 610 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-217ENST00000550044 IL2RGP31785 369 aa8.13□□□□□ -1.11
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