RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OPA3Q9H6K4 179 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUSP13Q9UII6 198 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FZR1Q9UM11 496 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 V9GYS6 101 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPTA1P02549 2419 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BSNQ9UPA5 3926 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD300LBA8K4G0 201 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDCD5O14737 125 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC22A1O15245 554 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SC5DO75845 299 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAS1P04201 325 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAC2P15153 192 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACKR3P25106 362 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SDC2P34741 201 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DDOSTP39656 456 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SELENOVP59797 346 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP3R1P63098 170 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSG7Q13046 419 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPCS2Q15005 226 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBXW12Q6X9E4 464 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP43Q70EL4 1123 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MOB3CQ70IA8 216 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5AS1Q8N127 324 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FTMTQ8N4E7 242 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDNFQ8TB73 568 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HAVCR1Q96D42 359 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TPK1Q9H3S4 243 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR173Q9NS66 373 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CMAHPQ9Y471 501 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1W2PPW3 197 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMIM30A4D0T7 59 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF850A8MQ14 1090 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAGEB3O15480 346 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLAUP00749 431 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NRASP01111 189 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATF1P18846 271 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB3AP20336 220 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MTNR1BP49286 362 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR8B8Q15620 311 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6ZSR3 168 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRP11Q86VZ4 500 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NUP37Q8NFH4 326 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PP6455Q8WZ26 134 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NEUROG1Q92886 237 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ITFG2Q969R8 447 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C10orf35Q96D05 121 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYT3Q9BQG1 590 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NEK6Q9HC98 313 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CA10Q9NS85 328 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM100Q9NV29 134 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZGRF1Q86YA3 2104 aa7.3□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SHISA3A0PJX4 238 aa7.29□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A1L4Q6 167 aa7.29□□□□□ -1.24
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