RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 SYS1Q8N2H4 156 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 MS4A15Q8N5U1 240 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 LSMEM1Q8N8F7 131 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 LINC01555Q8NAE3 123 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 UXS1Q8NBZ7 420 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 FAM71CQ8NEG0 241 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR2L5Q8NG80 312 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR8H1Q8NGG4 311 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR52L1Q8NGH7 329 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR2L8Q8NGY9 312 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR51Q1Q8NH59 317 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR56B4Q8NH76 319 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR8D1Q8WZ84 308 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 RAB7BQ96AH8 199 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 MS4A6EQ96DS6 147 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR7D2Q96RA2 312 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 MCHR1Q99705 422 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PRSS27Q9BQR3 290 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 TIMM29Q9BSF4 260 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ACTR6Q9GZN1 396 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ZNF350Q9GZX5 532 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 HDHD2Q9H0R4 259 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR52D1Q9H346 318 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 UBQLN3Q9H347 655 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 NARFLQ9H6Q4 476 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 NANSQ9NR45 359 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 NUDT15Q9NV35 164 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 C14orf105Q9NVL8 296 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 TRPC4Q9UBN4 977 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 UBQLN2Q9UHD9 624 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 IL20RAQ9UHF4 553 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 KIF25Q9UIL4 384 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 FBXL3Q9UKT7 428 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 TBX21Q9UL17 535 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 MGAT4AQ9UM21 535 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 BAIAP2Q9UQB8 552 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 RASD1Q9Y272 281 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 KCNE3Q9Y6H6 103 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 DENND4AQ7Z401 1863 aa3.52□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 C2CD4DB7Z1M9 353 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 BTN3A3O00478 584 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 GPR171O14626 319 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 FLRT2O43155 660 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ERI3O43414 337 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 STX11O75558 287 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 B3GALNT1O75752 331 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 GATBO75879 557 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 RCBTB2O95199 551 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 SLC2A10O95528 541 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 MPC2O95563 127 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 AK1P00568 194 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 SERPINA3P01011 423 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 IFNA7P01567 189 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 IL5P05113 134 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 GIPP09681 153 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 SBK2P0C263 348 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 SLC35G4P0C7Q5 338 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CPN1P15169 458 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 IL9P15248 144 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ATF1P18846 271 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 RAB3BP20337 219 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 C4BPBP20851 252 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 NT5EP21589 574 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PAICSP22234 425 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 HTR2AP28223 471 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 METAP1P53582 386 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 OR10A3P58181 314 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 AP3S2P59780 193 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ERVK-16P61578 105 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ST8SIA6P61647 398 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ACTA2P62736 377 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ACTG2P63267 376 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PITPNAQ00169 270 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 TNFRSF17Q02223 184 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 ZNF85Q03923 595 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 TGM3Q08188 693 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 PUDPQ08623 228 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CAMK2DQ13557 499 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CRMP1Q14194 572 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 INSL4Q14641 139 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 CDK5R1Q15078 307 aa3.51□□□□□ -1.85
SGCE-211ENST00000522045 AANATQ16613 207 aa3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms