RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF264O43296 627 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 DPM1O60762 260 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 CCDC22O60826 627 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 CTNSO60931 367 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 VPS26AO75436 327 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 STX11O75558 287 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 VAMP5O95183 116 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 UGT2B4P06133 528 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 CRHP06850 196 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 GSTA1P08263 222 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 RBP1P09455 135 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 NPIPA8P0DM63 369 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 SLC2A1P11166 492 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 COX4I1P13073 169 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ADRB3P13945 408 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 HTR1EP28566 365 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 IL12BP29460 328 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 XCR1P46094 333 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 UCP2P55851 309 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 OR2B6P58173 313 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 RPS15P62841 145 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 CDK16Q00536 496 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 CD47Q08722 323 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PDZK1IP1Q13113 114 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 POU6F1Q14863 301 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PDK3Q15120 406 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PDK4Q16654 411 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 NDUFAF6Q330K2 333 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 IFI44LQ53G44 452 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 C2orf83Q53S99 150 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 C9orf64Q5T6V5 341 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 GPR157Q5UAW9 335 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 HACD4Q5VWC8 232 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 NKAIN2Q5VXU1 208 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 CYB5R2Q6BCY4 276 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 WDR88Q6ZMY6 472 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 Q6ZSR6 202 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM135Q86UB9 458 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PARGQ86W56 976 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM17Q86X19 198 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 STK40Q8N2I9 435 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 SYT14Q8NB59 555 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ACBD4Q8NC06 268 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 OR10H4Q8NGA5 316 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 OR4A15Q8NGL6 344 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 OR4A16Q8NH70 328 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 GPX8Q8TED1 209 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 GLYATL2Q8WU03 294 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 FAM172AQ8WUF8 416 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 NAT14Q8WUY8 206 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 C22orf15Q8WYQ4 148 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 KLK6Q92876 244 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ART4Q93070 314 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 HIST1H2ACQ93077 130 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 FAM131CQ96AQ9 280 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ECHDC3Q96DC8 303 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 RNF145Q96MT1 663 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ACCSQ96QU6 501 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 SMR3AQ99954 134 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 SPNS1Q9H2V7 528 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ASB7Q9H672 318 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 NARFLQ9H6Q4 476 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 FN3KRPQ9HA64 309 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 SIAEQ9HAT2 523 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 ESM1Q9NQ30 184 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 SDHAF2Q9NX18 166 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 DPM3Q9P2X0 92 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 CHRNA9Q9UGM1 479 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 BTNL2Q9UIR0 455 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 NTNG1Q9Y2I2 539 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 NDUFAF1Q9Y375 327 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 A0A1B0GUH1 482 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 A0A1B0GV90 55 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 FAM92AA1XBS5 289 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 FRG2CA6NGY1 282 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 TUBAL3A6NHL2 446 aa3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-220ENST00000512069 METTL15A6NJ78 407 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms