RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 CFL1P23528 166 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 GNALP38405 381 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC25A1P53007 311 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 CRMP1Q14194 572 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 SNCBQ16143 134 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 OLFML2AQ68BL7 652 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 LYPD4Q6UWN0 246 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP2R1Q6VVX0 501 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 DPY19L4Q7Z388 723 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 GCSAMQ8N6F7 178 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 AQP11Q8NBQ7 271 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 ST8SIA4Q92187 359 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 TBX15Q96SF7 602 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 CHIAQ9BZP6 476 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM96BQ9Y3D0 163 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP2-220ENST00000511663 CLPSL1A2RUU4 121 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 RIIAD1A6NNX1 92 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 TIPRLO75663 272 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 DCTN3O75935 186 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 LHBP01229 141 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 GYPBP06028 91 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 MMP9P14780 707 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF3P17036 446 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SPI1P17947 270 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 CX3CR1P49238 355 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 RPL15P61313 204 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 DEFA6Q01524 100 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 POU4F2Q12837 409 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 PCK2Q16822 640 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 TEX36Q5VZQ5 186 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC16A9Q7RTY1 509 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM90A1Q86YD7 464 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 FTMTQ8N4E7 242 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC29Q8WV35 223 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 DYRK2Q92630 601 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SPSB4Q96A44 273 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 OTULINQ96BN8 352 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 REEP6Q96HR9 211 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 CCT8L2Q96SF2 557 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 REEP1Q9H902 201 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SMURF1Q9HCE7 757 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 C1RLQ9NZP8 487 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 ACTR3BQ9P1U1 418 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 KAAG1Q9UBP8 84 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 C5orf63A6NC05 138 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP8B1O43520 1251 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 NDUFA7O95182 113 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 BRICD5Q6PL45 260 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 CMTM4Q8IZR5 234 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 OR52H1Q8NGJ2 320 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 OR8D4Q8NGM9 314 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SGK3Q96BR1 496 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 DPAGT1Q9H3H5 408 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 ARL8BQ9NVJ2 186 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 DHRS12A0PJE2 317 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 ANXA2P2A6NMY6 339 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 TIMM23O14925 209 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR37O15354 613 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 NDUFB3O43676 98 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM3AP98173 230 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 MICAQ29983 383 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 CDONQ4KMG0 1287 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM57BQ71RH2 274 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SHFQ7M4L6 423 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 OR1M1Q8NGA1 313 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 OR6N2Q8NGY6 317 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 WFDC12Q8WWY7 111 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 INTS14Q96SY0 518 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 CCL13Q99616 98 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 MICU1Q9BPX6 476 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SIRPDQ9H106 197 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 OR10A2Q9H208 303 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 MAGIXQ9H6Y5 334 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 ARMC1Q9NVT9 282 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 KPTNQ9Y664 436 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 U3KQV3 271 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1B0GVI7 797 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 M0QZ24 198 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SOX14O95416 240 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 H2BFMP0C1H6 154 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 CLUP10909 449 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 PSKH1P11801 424 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 IL5RAQ01344 420 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BP2-220ENST00000511663 GFOD2Q3B7J2 385 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms