RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-208	ENST00000511439	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GSTT2	P0CG29	244 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GSTT2B	P0CG30	244 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	BCKDHA	P12694	445 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SDC1	P18827	310 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CMPK1	P30085	196 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ATP5O	P48047	213 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	LHX2	P50458	406 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	AIF1	P55008	147 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CDH6	P55285	790 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CLDN18	P56856	261 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SKP1	P63208	163 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GBE1	Q04446	702 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	UBE2V2	Q15819	145 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CBLN3	Q6UW01	205 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ARC	Q7LC44	396 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF677	Q86XU0	584 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR8K3	Q8NH51	312 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF607	Q96SK3	696 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DPH7	Q9BTV6	452 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PAXX	Q9BUH6	204 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PROK2	Q9HC23	129 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	NT5M	Q9NPB1	228 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	IL26	Q9NPH9	171 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DUX4	Q9UBX2	424 aa		2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	MED12L	Q86YW9	2145 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	LANCL1	O43813	399 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR4F21	O95013	312 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PIRT	P0C851	137 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ATP6V1C1	P21283	382 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PSMB5	P28074	263 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PTGFR	P43088	359 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	MAGEA1	P43355	309 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	MEOX2	P50222	304 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ACTR3	P61158	418 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	UBE2H	P62256	183 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	BTG2	P78543	158 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PUDP	Q08623	228 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ASAH1	Q13510	395 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PON3	Q15166	354 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CYP51A1	Q16850	503 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GSG1	Q2KHT4	349 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	RNF212	Q495C1	297 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	NPW	Q8N729	165 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	NAT14	Q8WUY8	206 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	RILP	Q96NA2	401 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR2A5	Q96R48	311 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR5M11	Q96RB7	305 aa		2.54	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	TM2D1	Q9BX74	207 aa		2.54	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms