RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 J3QLI3 93 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF264O43296 627 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 TPST2O60704 377 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV3-13P01766 116 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 KRT14P02533 472 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 GSTA1P08263 222 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 ALOX5P09917 674 aa3.59□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 RAG2P55895 527 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 CDH17Q12864 832 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 GPR50Q13585 617 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 NNATQ16517 81 aa3.59□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 FBXO48Q5FWF7 155 aa3.59□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.59□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 TTLQ8NG68 377 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 OR7A2PQ8NGA2 310 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 OR5M1Q8NGP8 315 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 CLDND2Q8NHS1 167 aa3.59□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 RASL10AQ92737 203 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 NEIL2Q969S2 332 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 MS4A6EQ96DS6 147 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 NRBF2Q96F24 287 aa3.59□□□□□ -1.83
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PDE4D-217ENST00000509355 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 ROGDIQ9GZN7 287 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 PTGES2Q9H7Z7 377 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 LYRM4Q9HD34 91 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 IL20Q9NYY1 176 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 TREM2Q9NZC2 230 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 UVRAGQ9P2Y5 699 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 GALPQ9UBC7 116 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 MIOXQ9UGB7 285 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 RPH3ALQ9UNE2 315 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 IFT52Q9Y366 437 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-217ENST00000509355 HEATR5AQ86XA9 2040 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 CIB4A0PJX0 185 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 C5orf63A6NC05 138 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 LRIT2A6NDA9 550 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OR5H1A6NKK0 313 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 GOLGA8MH3BSY2 632 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 RNF13O43567 381 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 CXCL13O43927 109 aa3.58□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 Q6ZT83 130 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 H2AFVQ71UI9 128 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 DPY19L4Q7Z388 723 aa3.58□□□□□ -1.84
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PDE4D-217ENST00000509355 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF786Q8N393 782 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 PARP8Q8N3A8 854 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 GPR137CQ8N3F9 429 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 COMMD1Q8N668 190 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 SPERTQ8NA61 448 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 BPIFCQ8NFQ6 507 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-217ENST00000509355 OR2L5Q8NG80 312 aa3.58□□□□□ -1.84
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