RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 WBP4O75554 376 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHA1P01876 353 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 INHBBP09529 407 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 PIPP12273 146 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 CPT2P23786 658 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 CD200P41217 278 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 CHN2P52757 468 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF85Q03923 595 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF181Q2M3W8 571 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 GFOD2Q3B7J2 385 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF684Q5T5D7 378 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM244Q5VVB8 128 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 FDX2Q6P4F2 183 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 DOK3Q7L591 496 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 ELMOD2Q8IZ81 293 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 OR56B2PQ8NGI1 322 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 OR11L1Q8NGX0 322 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 APH1BQ8WW43 257 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 SIGLEC11Q96RL6 698 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 MICU1Q9BPX6 476 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 ALG8Q9BVK2 526 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1B0GVI7 797 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 H7C1Q1 480 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 PPIHO43447 177 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM20BO75063 409 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 DHRS3O75911 302 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 RPP14O95059 124 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 APOL3O95236 402 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 CST4P01036 141 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 HTR1AP08908 422 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC159P0C7I6 412 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 CCR9P51686 369 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 AQP4P55087 323 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 CDH15P55291 814 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 RIN1Q13671 783 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 Q6ZR03 302 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 KRT74Q7RTS7 529 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 OR52I1Q8NGK6 324 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 CNIH3Q8TBE1 160 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 FBLIM1Q8WUP2 373 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 CCL17Q92583 94 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM80Q96HE8 168 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 MEGF10Q96KG7 1140 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 COX4I2Q96KJ9 171 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 TECTBQ96PL2 329 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2V2Q96R30 315 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 FN3KRPQ9HA64 309 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 NEK6Q9HC98 313 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 AMBNQ9NP70 447 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM36Q9NQ86 728 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 ERVK13-1Q9NX77 482 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 ENPP5Q9UJA9 477 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB26Q9ULW5 256 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 VWC2LB2RUY7 222 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF223E7ERA6 249 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 J3QLW9 94 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 FSTL3O95633 263 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 CLIC3O95833 236 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 SERPINA3P01011 423 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF19P17023 458 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 CA6P23280 308 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 GATA4P43694 442 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNJ8Q15842 424 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 IZUMO2Q6UXV1 221 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 STX19Q8N4C7 294 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 KLHL36Q8N4N3 616 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 OR51E1Q8TCB6 317 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 NRG4Q8WWG1 115 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 MYDGFQ969H8 173 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 RTL8AQ9BWD3 113 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 COMMD4Q9H0A8 199 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 G6PC2Q9NQR9 355 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM106BQ9NUM4 274 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 TPRKBQ9Y3C4 175 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 CSMD1Q96PZ7 3565 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM64A6NGJ6 449 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM64BA6NI03 449 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM210A6NLX4 147 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 CDC14BO60729 498 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 NCR1O76036 304 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 LY6HO94772 140 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 IGLV3-1P01715 115 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 TTRP02766 147 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 COL8A2P25067 703 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 GZMKP49863 264 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC58Q4VC31 144 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP2-208ENST00000504294 TP53I3Q53FA7 332 aa12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms